More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1853 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  93.06 
 
 		 447 aa  842    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  100 
 
 		 446 aa  900    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  93.06 
 
 		 447 aa  842    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  55.33 
 
 		 443 aa  485  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  51.12 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  53.99 
 
 		 442 aa  414  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  51.58 
 
 		 491 aa  410  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  32.23 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  43.2 
 
 		 460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  29.14 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  32.93 
 
 		 459 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  51.02 
 
 		 229 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  30.7 
 
 		 455 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  28.3 
 
 		 459 aa  155  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  32.61 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  30.87 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  30.7 
 
 		 455 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.72 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  44.2 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  31.63 
 
 		 384 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  54.78 
 
 		 321 aa  141  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  29.52 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  53.91 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  30.72 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  30.3 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  48.84 
 
 		 367 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  43.89 
 
 		 392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  30.6 
 
 		 439 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  48.89 
 
 		 392 aa  136  8e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  30.07 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  48.63 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  48.06 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  40.43 
 
 		 288 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  52.14 
 
 		 325 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  37.83 
 
 		 402 aa  134  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  46.79 
 
 		 375 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  45.67 
 
 		 300 aa  133  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  53.39 
 
 		 298 aa  132  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  37.17 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45.39 
 
 		 238 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  46.77 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  48.03 
 
 		 404 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  54.78 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  47.01 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  40.12 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  45.67 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  50.43 
 
 		 305 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  50.43 
 
 		 305 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  50.43 
 
 		 305 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  40.96 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  47.37 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  31.07 
 
 		 450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  52.63 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  43.29 
 
 		 233 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44.35 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  54.63 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  48.06 
 
 		 325 aa  127  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  40.74 
 
 		 243 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  52.83 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  44.09 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  49.21 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  34.25 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  51.75 
 
 		 324 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  53.77 
 
 		 582 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  43.26 
 
 		 262 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.66 
 
 		 411 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  46.61 
 
 		 282 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.84 
 
 		 751 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  43.55 
 
 		 373 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  45.04 
 
 		 316 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  40.14 
 
 		 337 aa  122  9e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  45.24 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  39.18 
 
 		 305 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  47.52 
 
 		 302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  38.46 
 
 		 372 aa  121  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.97 
 
 		 301 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.74 
 
 		 238 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  46.05 
 
 		 299 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  50.77 
 
 		 524 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  46.15 
 
 		 412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  40.28 
 
 		 735 aa  119  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  46.88 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  44.96 
 
 		 238 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  35.98 
 
 		 296 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  50.39 
 
 		 198 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  38.51 
 
 		 318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.65 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  32.87 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  44.09 
 
 		 314 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  30.38 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  49.57 
 
 		 323 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  46.03 
 
 		 404 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  49.61 
 
 		 198 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  40.57 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  50.38 
 
 		 348 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  48.03 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  48.09 
 
 		 358 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  43.61 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  51.3 
 
 		 271 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  40.94 
 
 		 308 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>