More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0655 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  100 
 
 		 337 aa  697    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  51.18 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  51.04 
 
 		 333 aa  335  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  40.19 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  39.81 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  37.54 
 
 		 314 aa  238  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  38.77 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  38.92 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  36.69 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  36.96 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  34.49 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  35.62 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  32.52 
 
 		 317 aa  181  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  33.01 
 
 		 296 aa  182  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  34.55 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  34.77 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  32.67 
 
 		 300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  32.33 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  36.97 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  44.87 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  30.94 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  38.65 
 
 		 325 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  36.56 
 
 		 233 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.62 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  37.25 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  40.48 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  31.64 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  34.85 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  37.65 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  48.06 
 
 		 443 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  39.46 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  39.46 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  42.42 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  40.14 
 
 		 446 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  41.38 
 
 		 445 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  44.96 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  42.54 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  44.29 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  40.88 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  41.91 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  48.28 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.75 
 
 		 229 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.84 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  33.22 
 
 		 323 aa  119  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  48.28 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  42.54 
 
 		 238 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  47.41 
 
 		 305 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  48.28 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.19 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  42.25 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  43.85 
 
 		 288 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  44.83 
 
 		 305 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  49.57 
 
 		 334 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  45.31 
 
 		 491 aa  115  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  45.61 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  36.16 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  35.59 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  46.55 
 
 		 299 aa  114  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  40.79 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  35.21 
 
 		 412 aa  113  4.0000000000000004e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  42.65 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  47.54 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  41.91 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.33 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  41.86 
 
 		 459 aa  113  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  35.21 
 
 		 375 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.4 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  43.2 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  41.6 
 
 		 386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  39.02 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.02 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  42.28 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  43.26 
 
 		 247 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  40.15 
 
 		 223 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  41.41 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  45 
 
 		 271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  46.55 
 
 		 524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.35 
 
 		 569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  45.83 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  39.61 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  41.6 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  45 
 
 		 271 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  42.19 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  42 
 
 		 460 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  42.86 
 
 		 490 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  44.72 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  43.88 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  39.84 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  37.35 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.22 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  40.31 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  39.69 
 
 		 313 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  41.32 
 
 		 464 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.18 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  40.83 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  40.56 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  39.06 
 
 		 301 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  39.08 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  40.31 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  39.74 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>