More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1270 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  100 
 
 
341 aa  706    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  34.55 
 
 
313 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  35.36 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  45.21 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  42.47 
 
 
300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  32.68 
 
 
299 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  41.1 
 
 
325 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  37.21 
 
 
305 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.38 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  39.6 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.38 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.07 
 
 
305 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.07 
 
 
305 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  39.35 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  31.82 
 
 
286 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  32.87 
 
 
446 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  38.41 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.47 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  30.07 
 
 
318 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.61 
 
 
321 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.36 
 
 
387 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  42.64 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  39.74 
 
 
334 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  28.97 
 
 
301 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  32.81 
 
 
305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  42.86 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  36.36 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.9 
 
 
445 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  30.52 
 
 
325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  45.74 
 
 
417 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  41.41 
 
 
296 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  42.74 
 
 
377 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.28 
 
 
238 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  41.67 
 
 
316 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.37 
 
 
303 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  44.54 
 
 
312 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  32.44 
 
 
443 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  40.31 
 
 
233 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  30.26 
 
 
305 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  43.7 
 
 
299 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  37.58 
 
 
299 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  40.29 
 
 
302 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  39.57 
 
 
384 aa  106  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  40.83 
 
 
292 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.46 
 
 
442 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  32.73 
 
 
455 aa  105  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  40 
 
 
299 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  41.61 
 
 
333 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  39.86 
 
 
491 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.01 
 
 
343 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  42.86 
 
 
307 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  33.51 
 
 
310 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  37.84 
 
 
308 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  42.11 
 
 
460 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  34.91 
 
 
300 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.18 
 
 
298 aa  103  6e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  43.1 
 
 
337 aa  103  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  37.59 
 
 
299 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.39 
 
 
527 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  39.42 
 
 
333 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  37.98 
 
 
315 aa  102  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  38.13 
 
 
288 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  37.5 
 
 
299 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  41.8 
 
 
569 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  36.84 
 
 
299 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  37.41 
 
 
323 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.42 
 
 
304 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  33.73 
 
 
271 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  29.28 
 
 
453 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  29.19 
 
 
308 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  41.27 
 
 
402 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  36.43 
 
 
288 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  30.37 
 
 
457 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  27.78 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  37.68 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  31.67 
 
 
440 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  33.11 
 
 
341 aa  99.8  6e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  38.66 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  36.07 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  38.71 
 
 
299 aa  99.8  6e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  35.34 
 
 
299 aa  99.8  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  35.34 
 
 
299 aa  99.4  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  36.23 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  35.34 
 
 
299 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  35.34 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  44.07 
 
 
412 aa  99.4  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  35.34 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  35.34 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  35.34 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  35.34 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  37.76 
 
 
459 aa  99.4  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  35.34 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  41.86 
 
 
271 aa  99.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  33.33 
 
 
439 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  29.52 
 
 
456 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  39.29 
 
 
238 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  37.7 
 
 
533 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  42.06 
 
 
376 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  38.71 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  27.6 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>