More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6051 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  100 
 
 		 382 aa  742    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  76.32 
 
 		 415 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  52.37 
 
 		 392 aa  340  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  51.37 
 
 		 391 aa  335  7e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  50.67 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  42.86 
 
 		 454 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  41.88 
 
 		 455 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.19 
 
 		 455 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  41.47 
 
 		 457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  41.21 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  40.62 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  41.25 
 
 		 453 aa  264  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  46.63 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  35.35 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  37.31 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  36.55 
 
 		 450 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  37.43 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  34.88 
 
 		 440 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  33.33 
 
 		 439 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  40.53 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  41.01 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  40.36 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  31.35 
 
 		 459 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  54.01 
 
 		 233 aa  144  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  45.32 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  32.64 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  50.78 
 
 		 302 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  45.86 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  40 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  51.16 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  52.38 
 
 		 229 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  46.76 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  36.21 
 
 		 460 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36.44 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  54.24 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  41.62 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  50.36 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  51.72 
 
 		 314 aa  132  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  45.19 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  40.89 
 
 		 327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  38.49 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  52.34 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  36.6 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  48.87 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  41.99 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  56.41 
 
 		 243 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  41.63 
 
 		 296 aa  129  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.98 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  50.77 
 
 		 288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  53.85 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  30.62 
 
 		 443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  50.79 
 
 		 411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  49.18 
 
 		 377 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  52.34 
 
 		 394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  49.21 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  40.57 
 
 		 446 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  49.21 
 
 		 399 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  52.59 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  48.87 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  42.86 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  46.97 
 
 		 318 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  53.04 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  46.92 
 
 		 538 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  52.14 
 
 		 238 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  47.86 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  46.15 
 
 		 325 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  44.59 
 
 		 287 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  39.43 
 
 		 445 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  53.85 
 
 		 238 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  41.61 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.51 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  45.74 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  42.66 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  45.74 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  44.53 
 
 		 300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  50.86 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  46.32 
 
 		 299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  51.28 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.18 
 
 		 238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  46.32 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  37.81 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  41.4 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  46.32 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  48.28 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  36.14 
 
 		 315 aa  120  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  43.38 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  43.07 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  44.27 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  52.59 
 
 		 328 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  50.43 
 
 		 441 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  46.32 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.26 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.26 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  38.65 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.04 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  47.5 
 
 		 318 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  49.18 
 
 		 372 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  35.23 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  52.59 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  49.15 
 
 		 431 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>