More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1912 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  93.86 
 
 
440 aa  850    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  100 
 
 
439 aa  899    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  52.42 
 
 
430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  51 
 
 
442 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  44.77 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  38 
 
 
423 aa  279  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.12 
 
 
456 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  38.62 
 
 
453 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  38.34 
 
 
455 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  39.11 
 
 
459 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  38.59 
 
 
457 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  35.65 
 
 
455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  38.28 
 
 
454 aa  246  6e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  34.01 
 
 
392 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  34.25 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  33.42 
 
 
382 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  32.43 
 
 
415 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  34.94 
 
 
414 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  27.71 
 
 
459 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  48.75 
 
 
392 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  45.56 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  43.27 
 
 
460 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  29.45 
 
 
443 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  56.1 
 
 
375 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  50.67 
 
 
229 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.6 
 
 
446 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  42.55 
 
 
413 aa  136  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  46.63 
 
 
332 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  42.86 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  30.25 
 
 
445 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  38.29 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  41.62 
 
 
328 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  39.11 
 
 
384 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  30.26 
 
 
447 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  30.26 
 
 
447 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  51.52 
 
 
327 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  49.29 
 
 
238 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  40.25 
 
 
301 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  37.77 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  51.28 
 
 
310 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  37.77 
 
 
319 aa  127  5e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.18 
 
 
309 aa  126  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  38.07 
 
 
387 aa  126  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  42.7 
 
 
288 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.83 
 
 
375 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  51.72 
 
 
299 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  51.72 
 
 
299 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.69 
 
 
411 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  51.72 
 
 
299 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  51.72 
 
 
299 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  51.72 
 
 
299 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  50.86 
 
 
299 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  50.86 
 
 
299 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  50.86 
 
 
299 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  50.86 
 
 
299 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  50 
 
 
299 aa  124  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  43.14 
 
 
300 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  48.15 
 
 
330 aa  124  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  39.08 
 
 
318 aa  123  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  43.27 
 
 
290 aa  123  8e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  49.14 
 
 
375 aa  123  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  46.48 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  49.22 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  48.44 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  44 
 
 
303 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  46.53 
 
 
233 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  50 
 
 
299 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  44.81 
 
 
305 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  41.48 
 
 
296 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  53.98 
 
 
541 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  52.25 
 
 
400 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  45.03 
 
 
282 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  40 
 
 
299 aa  120  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  47.41 
 
 
292 aa  120  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  43.18 
 
 
332 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  50 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  43.36 
 
 
308 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  48.28 
 
 
299 aa  119  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  47.9 
 
 
379 aa  119  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  49.14 
 
 
299 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  45.07 
 
 
301 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  48.28 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  45.52 
 
 
288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  46.15 
 
 
315 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  47.01 
 
 
377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  39.38 
 
 
299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  34.92 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  48.7 
 
 
404 aa  118  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  51.64 
 
 
524 aa  117  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  47.69 
 
 
319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  50.43 
 
 
238 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  37.22 
 
 
305 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.06 
 
 
491 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  50.43 
 
 
243 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.78 
 
 
238 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  48.67 
 
 
430 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  50 
 
 
300 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  36.96 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.24 
 
 
376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  47.41 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>