More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2875 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  100 
 
 
282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34.06 
 
 
309 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  47.44 
 
 
379 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  43.23 
 
 
441 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  33.96 
 
 
323 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  34.07 
 
 
301 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  42.59 
 
 
300 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  40.11 
 
 
304 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  30.66 
 
 
301 aa  142  7e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  41.98 
 
 
375 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  54.55 
 
 
431 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  35.24 
 
 
400 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  49.18 
 
 
404 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  53.85 
 
 
452 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  50.41 
 
 
411 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  33.45 
 
 
308 aa  138  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  52.85 
 
 
373 aa  137  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  44.51 
 
 
541 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  50 
 
 
404 aa  135  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.44 
 
 
375 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  42.5 
 
 
415 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  46.94 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.94 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  28.88 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  45.38 
 
 
247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  34.08 
 
 
305 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  34.08 
 
 
305 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  40 
 
 
299 aa  132  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.96 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  51.22 
 
 
379 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  41.18 
 
 
299 aa  132  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  40.82 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.55 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  30.22 
 
 
367 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.25 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  38.12 
 
 
377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  45.77 
 
 
430 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  46.67 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  46.15 
 
 
302 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  47.76 
 
 
412 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  47.11 
 
 
605 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  39.75 
 
 
223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  39.26 
 
 
375 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  52.07 
 
 
324 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.67 
 
 
455 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.72 
 
 
305 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  48.36 
 
 
374 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  44.44 
 
 
238 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  48.76 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  50.83 
 
 
399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  50.83 
 
 
399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45.74 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  44.76 
 
 
456 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  48.25 
 
 
469 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  46.34 
 
 
238 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  31.82 
 
 
299 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  35.15 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  48.78 
 
 
376 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  44.38 
 
 
265 aa  126  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  30.07 
 
 
299 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  46.32 
 
 
454 aa  125  6e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  48.76 
 
 
377 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  30.9 
 
 
299 aa  125  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  31.7 
 
 
299 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  48.33 
 
 
316 aa  125  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  38.24 
 
 
293 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  39.47 
 
 
317 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  47.66 
 
 
216 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  43.67 
 
 
413 aa  125  9e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  46.15 
 
 
453 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  47.01 
 
 
388 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  46.61 
 
 
446 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  45.45 
 
 
455 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  38.29 
 
 
299 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  28.77 
 
 
299 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  49.14 
 
 
379 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  43.62 
 
 
412 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  46.83 
 
 
538 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  33.33 
 
 
387 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  44.09 
 
 
372 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  39.52 
 
 
299 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  44.72 
 
 
243 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  43.66 
 
 
457 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  45.19 
 
 
459 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  37.38 
 
 
273 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  33.59 
 
 
334 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  29.59 
 
 
313 aa  122  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  37.8 
 
 
332 aa  122  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  38.01 
 
 
300 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  35.47 
 
 
362 aa  122  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  48.76 
 
 
582 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  44.26 
 
 
374 aa  122  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  44.8 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  45.32 
 
 
656 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  38.92 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  38.92 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  37.79 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  43.8 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  48.33 
 
 
430 aa  120  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  38.8 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>