More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0362 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  100 
 
 
299 aa  617  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  84.62 
 
 
299 aa  519  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  79.87 
 
 
299 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  79.53 
 
 
299 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  78.19 
 
 
299 aa  501  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  80.81 
 
 
299 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  80.94 
 
 
299 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  80.94 
 
 
299 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  80.6 
 
 
299 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  80.54 
 
 
299 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  80.87 
 
 
299 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  80.87 
 
 
299 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  80.94 
 
 
299 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  80.94 
 
 
299 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  75.84 
 
 
299 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  79.53 
 
 
299 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  43.37 
 
 
292 aa  251  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  42.9 
 
 
318 aa  251  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.54 
 
 
298 aa  251  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  47.76 
 
 
310 aa  237  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  43 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  42.4 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  46.12 
 
 
315 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  41.15 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  42.74 
 
 
306 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  39.92 
 
 
307 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  35.86 
 
 
319 aa  176  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  35.86 
 
 
369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  36.5 
 
 
318 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  38.74 
 
 
313 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  39.53 
 
 
321 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  39.53 
 
 
321 aa  155  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  39.15 
 
 
320 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  38.12 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  37.39 
 
 
288 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  36.82 
 
 
328 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.57 
 
 
321 aa  143  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  41.88 
 
 
384 aa  142  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  33.02 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  34.03 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  36.67 
 
 
316 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  36.67 
 
 
290 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  32.64 
 
 
305 aa  138  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  49.58 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  36.48 
 
 
340 aa  136  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  36.68 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  33.33 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  40 
 
 
282 aa  132  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  39.36 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  40.88 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.56 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  40.93 
 
 
394 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  53.04 
 
 
443 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  44.85 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  35.45 
 
 
319 aa  129  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  53.45 
 
 
457 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  50.86 
 
 
455 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  51.72 
 
 
456 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  28.89 
 
 
313 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.86 
 
 
309 aa  126  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  51.72 
 
 
459 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  52.59 
 
 
455 aa  126  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  46.72 
 
 
423 aa  125  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  34.27 
 
 
445 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  52.1 
 
 
238 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  28.62 
 
 
300 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  44.96 
 
 
402 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  47.54 
 
 
430 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50 
 
 
453 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.28 
 
 
243 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.69 
 
 
238 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  51.33 
 
 
413 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  30.4 
 
 
288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  41.03 
 
 
439 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  34.96 
 
 
415 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  46.61 
 
 
293 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.28 
 
 
301 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  40.35 
 
 
388 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.86 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.86 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  42.02 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  50 
 
 
440 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  34.26 
 
 
411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  46.09 
 
 
430 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  36.2 
 
 
379 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  29.71 
 
 
305 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.22 
 
 
304 aa  117  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  44.26 
 
 
387 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.75 
 
 
524 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  46.34 
 
 
302 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  46.72 
 
 
332 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.45 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  49.14 
 
 
308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  40.98 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  42.67 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  37.36 
 
 
460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  48 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  31.22 
 
 
399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  38.55 
 
 
450 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  32.09 
 
 
298 aa  113  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>