More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3080 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  100 
 
 		 321 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  96.57 
 
 		 320 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  87.81 
 
 		 321 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  54.66 
 
 		 310 aa  318  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  53.66 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  50.21 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  46.18 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  54.74 
 
 		 327 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  51.52 
 
 		 319 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  51.28 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  50.85 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  41.64 
 
 		 288 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  37.54 
 
 		 310 aa  209  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  39.94 
 
 		 332 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  46.28 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  43.11 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  44 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  41.23 
 
 		 369 aa  189  8e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  41.41 
 
 		 319 aa  188  9e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  39.57 
 
 		 318 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  42.31 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  36.33 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  40.57 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  36.25 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  41.18 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  41.51 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  41.51 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  40.57 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  39.62 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  40.09 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  40.57 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  38.31 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  37.86 
 
 		 307 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  40.57 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  40.57 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  40.57 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  40.57 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  36.93 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  35.78 
 
 		 299 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  39.15 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  39.15 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  38.68 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  39.15 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  39.15 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  35.37 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  34.63 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.37 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.37 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  35.47 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  33.33 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.75 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  55.47 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  39.11 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  31.68 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  47.77 
 
 		 384 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.38 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  50.69 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  50 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  49.19 
 
 		 399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  34.33 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  45.34 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  51.54 
 
 		 442 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  49.66 
 
 		 402 aa  132  6.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  47.69 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  35 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  43.29 
 
 		 282 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  46.1 
 
 		 457 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  42.95 
 
 		 423 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  34.71 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  32.34 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  29.93 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  43.92 
 
 		 445 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  47.29 
 
 		 455 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.53 
 
 		 454 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.6 
 
 		 229 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  34.57 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  42.86 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.5 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  43.51 
 
 		 459 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  51.26 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  32.91 
 
 		 453 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  47.5 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.72 
 
 		 243 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  50 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  50.42 
 
 		 238 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  47.1 
 
 		 443 aa  120  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  40.8 
 
 		 295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  49.57 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.19 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  36.7 
 
 		 415 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  52.5 
 
 		 452 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  50.82 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  46.09 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  29.17 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.01 
 
 		 301 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.84 
 
 		 303 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  47.5 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  41.43 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  53.57 
 
 		 541 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  41.62 
 
 		 439 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>