More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2849 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  74.4 
 
 		 456 aa  662    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  75.16 
 
 		 457 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  74.01 
 
 		 453 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  100 
 
 		 455 aa  922    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  74.19 
 
 		 459 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  67.47 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  63.97 
 
 		 454 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  37.95 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  40.84 
 
 		 391 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  41.16 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  38.84 
 
 		 442 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  38.04 
 
 		 439 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  40.62 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  36.1 
 
 		 430 aa  246  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  37.5 
 
 		 415 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  36.09 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  37.34 
 
 		 392 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  37.4 
 
 		 423 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  38.3 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  32.33 
 
 		 459 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  38.08 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  40.25 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  41.23 
 
 		 384 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  40.27 
 
 		 387 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  39.82 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  52.63 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.62 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  56.1 
 
 		 229 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.77 
 
 		 446 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  30.53 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  30.53 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  29.26 
 
 		 443 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  31.84 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  56.3 
 
 		 332 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  42.05 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  40.34 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  43.18 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  53.68 
 
 		 330 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  53.12 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  52.31 
 
 		 328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  50.81 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  53.03 
 
 		 290 aa  137  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  53.44 
 
 		 318 aa  137  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  45.7 
 
 		 305 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  51.52 
 
 		 319 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  52.27 
 
 		 316 aa  134  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  52.34 
 
 		 302 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  52.99 
 
 		 288 aa  133  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  49.19 
 
 		 404 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  41.45 
 
 		 288 aa  133  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.01 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  35.9 
 
 		 310 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  52.59 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  53.45 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  53.45 
 
 		 299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  43.96 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  49.23 
 
 		 233 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  48.39 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  46.27 
 
 		 238 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  38.02 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  52.59 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  33.46 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  51.72 
 
 		 299 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  40.8 
 
 		 296 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  52.76 
 
 		 332 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  52.59 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  49.28 
 
 		 313 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.09 
 
 		 314 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  52.59 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  52.59 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  52.59 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  49.22 
 
 		 319 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  35.96 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  42.62 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  43.12 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  45.59 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.2 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  50.86 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  51.72 
 
 		 299 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  49.14 
 
 		 292 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  35.94 
 
 		 299 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  35.94 
 
 		 299 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  35.94 
 
 		 299 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  35.94 
 
 		 299 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  49.22 
 
 		 369 aa  126  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  46.03 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  44.37 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  45.45 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  49.57 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  49.57 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  47.37 
 
 		 299 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  52.99 
 
 		 243 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  49.14 
 
 		 298 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  45.83 
 
 		 303 aa  124  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  48.18 
 
 		 299 aa  124  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  49.23 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  52.14 
 
 		 238 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  47.2 
 
 		 665 aa  122  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  47.83 
 
 		 305 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  56 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>