More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1864 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  100 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  50.41 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  51.67 
 
 
415 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  44.37 
 
 
455 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  38.82 
 
 
282 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  43.71 
 
 
457 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  45.03 
 
 
456 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  47.79 
 
 
423 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  47.93 
 
 
340 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  47.41 
 
 
288 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  46.36 
 
 
455 aa  123  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  43.62 
 
 
301 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  46.28 
 
 
309 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  52.25 
 
 
402 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  44.37 
 
 
454 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  49.59 
 
 
299 aa  122  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  48.39 
 
 
288 aa  122  9e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  47.74 
 
 
414 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  47.01 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  47.86 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  43.71 
 
 
459 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  48.72 
 
 
384 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  43.05 
 
 
453 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  45.76 
 
 
299 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.38 
 
 
430 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  46.61 
 
 
299 aa  119  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  44.07 
 
 
299 aa  119  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  45.31 
 
 
302 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  38.86 
 
 
305 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  36.19 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  43.7 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  39.62 
 
 
414 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  45.76 
 
 
299 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  40.74 
 
 
305 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  40.74 
 
 
305 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.74 
 
 
305 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  48.65 
 
 
387 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  45.75 
 
 
382 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  48.03 
 
 
332 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  46.34 
 
 
328 aa  116  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  45.53 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  42.48 
 
 
445 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  40.25 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  41.62 
 
 
319 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  48.65 
 
 
238 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  42.96 
 
 
325 aa  116  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  41.98 
 
 
363 aa  115  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  45.04 
 
 
569 aa  115  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  46.15 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  44.92 
 
 
299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.83 
 
 
229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  47.62 
 
 
394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  40.52 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.38 
 
 
450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  49.58 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  48.65 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  44.92 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  44.92 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  44.92 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  39.41 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  45.3 
 
 
316 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  45.97 
 
 
313 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  45.9 
 
 
411 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  43.09 
 
 
327 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.46 
 
 
328 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  47.86 
 
 
404 aa  113  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  40.36 
 
 
305 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  47.06 
 
 
538 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  41.04 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  45.69 
 
 
440 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  43.97 
 
 
324 aa  112  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  46.85 
 
 
439 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  47.97 
 
 
459 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.09 
 
 
442 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  44.07 
 
 
299 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  44.07 
 
 
299 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  44.7 
 
 
320 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  44.07 
 
 
299 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  44.07 
 
 
299 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  44.7 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  44.07 
 
 
299 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  47.58 
 
 
413 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.68 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  46.15 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  47.58 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  46.09 
 
 
446 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  43.94 
 
 
321 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.09 
 
 
375 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.35 
 
 
447 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.35 
 
 
447 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  47.58 
 
 
399 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.71 
 
 
527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  37.97 
 
 
471 aa  109  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  44.12 
 
 
490 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  43.33 
 
 
442 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  42.02 
 
 
315 aa  109  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.57 
 
 
248 aa  109  6e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  47.86 
 
 
391 aa  109  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  37.97 
 
 
471 aa  109  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  44.07 
 
 
379 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>