More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2753 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  100 
 
 
363 aa  734    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  44 
 
 
307 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  36.66 
 
 
417 aa  210  3e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  40.98 
 
 
412 aa  191  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  40.5 
 
 
430 aa  186  7e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  39.36 
 
 
274 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  42.8 
 
 
271 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  42.8 
 
 
271 aa  176  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  40.34 
 
 
271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  37.55 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  38.98 
 
 
278 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  37.24 
 
 
419 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  33.33 
 
 
283 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  37.02 
 
 
265 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  35.34 
 
 
295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  31.15 
 
 
295 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  32.82 
 
 
297 aa  130  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  31.76 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  32.53 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  46.15 
 
 
460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  48.33 
 
 
300 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  47.2 
 
 
238 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  46.4 
 
 
238 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.46 
 
 
442 aa  126  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.4 
 
 
300 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  44.06 
 
 
243 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  32.24 
 
 
314 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  49.18 
 
 
301 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.04 
 
 
375 aa  123  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  42.22 
 
 
468 aa  123  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  46.4 
 
 
374 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  47.01 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  46.9 
 
 
303 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  44.26 
 
 
431 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.15 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  47.46 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  46.67 
 
 
524 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  44.26 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  44.17 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  45.83 
 
 
527 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  39.75 
 
 
325 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  31.94 
 
 
284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  44.35 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  47.01 
 
 
387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  40.99 
 
 
376 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  40.65 
 
 
610 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  45 
 
 
301 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  42.5 
 
 
605 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  40 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.44 
 
 
411 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.97 
 
 
453 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  44.92 
 
 
460 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  44.74 
 
 
313 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  44.07 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.44 
 
 
399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.44 
 
 
399 aa  116  5e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  44.96 
 
 
457 aa  116  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  33.88 
 
 
320 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  45.16 
 
 
367 aa  116  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  45.3 
 
 
323 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  42.74 
 
 
455 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  41.55 
 
 
569 aa  115  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  37.66 
 
 
445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  47.2 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  38.99 
 
 
443 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  41.98 
 
 
293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.9 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.4 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44.88 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  34.29 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  33.47 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  40 
 
 
249 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0823  Peptidase M23  49.14 
 
 
429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.42 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  46.46 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  47.01 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.92 
 
 
491 aa  114  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  37.8 
 
 
310 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  29.88 
 
 
374 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  42.15 
 
 
400 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  38.03 
 
 
423 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  41.77 
 
 
372 aa  112  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  35.98 
 
 
282 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  36.65 
 
 
318 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.09 
 
 
309 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0207  Peptidase M23  46.62 
 
 
285 aa  112  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310777  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40.15 
 
 
454 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  46.77 
 
 
582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.37 
 
 
238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  45.9 
 
 
186 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  45.61 
 
 
271 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  45.13 
 
 
459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  41.26 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  39.23 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  43.7 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  27.2 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  42.74 
 
 
324 aa  110  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  41.26 
 
 
386 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  42.5 
 
 
285 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>