More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2548 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  44.17 
 
 		 430 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  36.78 
 
 		 363 aa  112  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  45.45 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  32.78 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  29.68 
 
 		 321 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.79 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.84 
 
 		 456 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  36.77 
 
 		 376 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  39.84 
 
 		 457 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.89 
 
 		 423 aa  99.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.86 
 
 		 375 aa  99  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  35.63 
 
 		 400 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  39.52 
 
 		 387 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  42.15 
 
 		 301 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  39.39 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  36.43 
 
 		 459 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  40.94 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  39.02 
 
 		 455 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  39.02 
 
 		 455 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  35.07 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  37.4 
 
 		 453 aa  96.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  40 
 
 		 288 aa  96.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  42.5 
 
 		 441 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  34.33 
 
 		 238 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  40.65 
 
 		 324 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.16 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.5 
 
 		 431 aa  96.3  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.29 
 
 		 454 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.46 
 
 		 527 aa  96.3  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  39.67 
 
 		 332 aa  95.5  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  37.01 
 
 		 457 aa  95.5  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  43.2 
 
 		 412 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  36 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  42.4 
 
 		 425 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  38.06 
 
 		 379 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  33.86 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  36.36 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  39.52 
 
 		 417 aa  93.6  4e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  41.6 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  42.4 
 
 		 421 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  36.22 
 
 		 457 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  42.4 
 
 		 421 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  36.22 
 
 		 457 aa  93.2  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.4 
 
 		 420 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.4 
 
 		 400 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  36.92 
 
 		 440 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  36.75 
 
 		 241 aa  92.4  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  44.92 
 
 		 375 aa  92.4  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  36.5 
 
 		 442 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  32.12 
 
 		 414 aa  92  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.77 
 
 		 454 aa  92  9e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  34.03 
 
 		 439 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  36.24 
 
 		 362 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  38.21 
 
 		 469 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  40 
 
 		 402 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  43.75 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  41.01 
 
 		 512 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.4 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  39.68 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  31.69 
 
 		 392 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  41.01 
 
 		 472 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  36.92 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  41.01 
 
 		 471 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  40.62 
 
 		 443 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  34.19 
 
 		 524 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.6 
 
 		 425 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  39.13 
 
 		 692 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  41.01 
 
 		 509 aa  89.4  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  39.17 
 
 		 229 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  41.01 
 
 		 470 aa  89.4  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  36.59 
 
 		 293 aa  89  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  42.86 
 
 		 216 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  38.4 
 
 		 377 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  40.68 
 
 		 310 aa  89  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  37.4 
 
 		 379 aa  89  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  37.17 
 
 		 430 aa  89  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  38.84 
 
 		 284 aa  89  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.52 
 
 		 312 aa  88.6  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.17 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  36.07 
 
 		 341 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  35.59 
 
 		 377 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  37.07 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  35.43 
 
 		 450 aa  88.2  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  41.53 
 
 		 373 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.98 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  41.32 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  35.9 
 
 		 442 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  34.88 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  30.99 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  39.84 
 
 		 271 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  39.32 
 
 		 339 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  30.28 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  40.16 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  36 
 
 		 302 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  36.59 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  36.75 
 
 		 314 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  34.88 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3330  Peptidase M23  36.67 
 
 		 256 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0172603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  34.88 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>