More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1858 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  100 
 
 		 375 aa  761    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  46.93 
 
 		 373 aa  330  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  41.24 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  42.26 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  38.42 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  36.96 
 
 		 377 aa  229  8e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  36.15 
 
 		 379 aa  223  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  35.21 
 
 		 374 aa  223  6e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  34.65 
 
 		 372 aa  209  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  34.45 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.93 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  35.59 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.61 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  33.58 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  34.75 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  32.07 
 
 		 399 aa  189  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  30.43 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  64.57 
 
 		 541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  31.65 
 
 		 404 aa  172  5.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  30.46 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  29.95 
 
 		 431 aa  165  9e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  31.41 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  52.26 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  28.61 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  29.03 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  56.45 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  49.03 
 
 		 452 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  36.36 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  55.12 
 
 		 430 aa  143  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  47.58 
 
 		 423 aa  139  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  50 
 
 		 324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  49.6 
 
 		 305 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  48.03 
 
 		 430 aa  135  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  53.28 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  49.59 
 
 		 247 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  42.77 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  32.64 
 
 		 445 aa  132  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  43.79 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  32.92 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  49.19 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  50.41 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  45.97 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  49.19 
 
 		 527 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  50.41 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  47.62 
 
 		 456 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  48.7 
 
 		 460 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  50 
 
 		 523 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  52.07 
 
 		 308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  46.15 
 
 		 274 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  25.38 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  51.2 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  36.04 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  48.76 
 
 		 472 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  47.58 
 
 		 367 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  54.62 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  54.62 
 
 		 471 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  48.84 
 
 		 490 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  54.62 
 
 		 512 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44.35 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  54.62 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  27.61 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  49.59 
 
 		 223 aa  127  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  46.83 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  54.62 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.46 
 
 		 321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  41.42 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  52.1 
 
 		 499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.29 
 
 		 243 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.86 
 
 		 304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  47.66 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  44.09 
 
 		 392 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  45.97 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  46.83 
 
 		 453 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  46.03 
 
 		 457 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.77 
 
 		 442 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  45.67 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  43.2 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  46.03 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  46.03 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  45.24 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  47.58 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  51.69 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  51.69 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  43.38 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  47.93 
 
 		 529 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  45.04 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  47.01 
 
 		 482 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  47.5 
 
 		 735 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.16 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  48.82 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  46.4 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  48.74 
 
 		 465 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.16 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  27.6 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  45.9 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  35.84 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  50 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  48.74 
 
 		 238 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  50 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  52.54 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>