More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0654 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  100 
 
 		 274 aa  567  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  63.09 
 
 		 223 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  57.31 
 
 		 247 aa  298  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  56.96 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  46.12 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.23 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  41.49 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  41.38 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  36.24 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.77 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  36.36 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  39.78 
 
 		 323 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  44.68 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.45 
 
 		 404 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  49.59 
 
 		 524 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  38.71 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  50.41 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  41.67 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  40.82 
 
 		 282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  38.12 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  39.15 
 
 		 300 aa  129  8.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  38.37 
 
 		 334 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  45.21 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  47.11 
 
 		 400 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  38.68 
 
 		 300 aa  125  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  50.4 
 
 		 376 aa  125  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.93 
 
 		 411 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  37.82 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  49.25 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  46.34 
 
 		 271 aa  123  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  37.18 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  37.18 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.41 
 
 		 375 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48 
 
 		 314 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  46.34 
 
 		 324 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  37.16 
 
 		 377 aa  122  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.31 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  49.59 
 
 		 419 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.75 
 
 		 527 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  44.63 
 
 		 373 aa  122  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.88 
 
 		 442 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  35.33 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  41.62 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  40.24 
 
 		 399 aa  122  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  36.6 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  40.24 
 
 		 399 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  37.24 
 
 		 374 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  37.58 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  44.7 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  51.22 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  47.5 
 
 		 317 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  43.71 
 
 		 379 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  44.27 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  44.2 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  42.54 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  46.15 
 
 		 582 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  37.29 
 
 		 317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  46.55 
 
 		 430 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  43.09 
 
 		 423 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  37.65 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  49.59 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  41.67 
 
 		 656 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  38.65 
 
 		 375 aa  118  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  44.88 
 
 		 262 aa  118  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.08 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  39.39 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  42.25 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  34.52 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  33.64 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  43.51 
 
 		 299 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  46.03 
 
 		 470 aa  116  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.77 
 
 		 372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  43.94 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  46.46 
 
 		 446 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  52.94 
 
 		 443 aa  116  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  42.15 
 
 		 404 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  45.61 
 
 		 362 aa  115  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  37.87 
 
 		 300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  47.24 
 
 		 442 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  44.19 
 
 		 450 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  46.34 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  47.97 
 
 		 388 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  45.45 
 
 		 464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  47.97 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  40.46 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  47.97 
 
 		 447 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  43.2 
 
 		 538 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  45.54 
 
 		 464 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  38.93 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  33.82 
 
 		 340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  46.61 
 
 		 216 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  43.7 
 
 		 471 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  43.33 
 
 		 379 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  40.52 
 
 		 453 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  39.06 
 
 		 445 aa  112  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  41.48 
 
 		 517 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.75 
 
 		 343 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  41.09 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  41.09 
 
 		 369 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  45.54 
 
 		 465 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>