More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2040 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  99.06 
 
 		 319 aa  642    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  100 
 
 		 369 aa  750    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  69.77 
 
 		 313 aa  418  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  61.06 
 
 		 318 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  45.74 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  44.21 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  45.39 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  41.74 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  41.03 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  41.39 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  43.75 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.07 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  41.1 
 
 		 321 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  38.06 
 
 		 299 aa  180  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  41.41 
 
 		 321 aa  179  9e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  40.81 
 
 		 328 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  37.25 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  40.36 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  34.15 
 
 		 292 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  42.15 
 
 		 288 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  37.78 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  37.65 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  40.97 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  37.65 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  37.13 
 
 		 299 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  37.13 
 
 		 299 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  39.91 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  37.55 
 
 		 299 aa  177  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  37.65 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  37.55 
 
 		 299 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  38.87 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  37.85 
 
 		 290 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  37.13 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  37.13 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  37.13 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  37.13 
 
 		 299 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  38.39 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  37.05 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  37.05 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  36.29 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  35.78 
 
 		 299 aa  162  7e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  38.66 
 
 		 340 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  35.09 
 
 		 299 aa  159  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  40.09 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  36.71 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  37.34 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  43.6 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  40.11 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.68 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  46.3 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.45 
 
 		 402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  35.45 
 
 		 296 aa  133  6e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.62 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  39.13 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  38.38 
 
 		 394 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  36.48 
 
 		 455 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  32 
 
 		 305 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.39 
 
 		 454 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  32 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  46.46 
 
 		 459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  32 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  37.77 
 
 		 439 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  38.17 
 
 		 442 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  43.05 
 
 		 423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  39.23 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  49.22 
 
 		 455 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  39.64 
 
 		 298 aa  125  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  37.56 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  46.27 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  36.65 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  51.28 
 
 		 241 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  37.78 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  29.33 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  45.31 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  40.53 
 
 		 440 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.32 
 
 		 453 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  47.93 
 
 		 443 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  32.91 
 
 		 430 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.78 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  50.83 
 
 		 273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  47.66 
 
 		 541 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  50.43 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  40.27 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  43.8 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  37.39 
 
 		 459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  48.84 
 
 		 392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  36.89 
 
 		 457 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  48.36 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  48.36 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  34.11 
 
 		 460 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  45.24 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  38.15 
 
 		 375 aa  116  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  42.21 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  31.43 
 
 		 313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  35.88 
 
 		 334 aa  116  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  35.85 
 
 		 415 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  46.55 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  49.14 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  45.69 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  54 
 
 		 754 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>