More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1041 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  100 
 
 
302 aa  619  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  59.4 
 
 
300 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  59.52 
 
 
300 aa  378  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  54.39 
 
 
296 aa  343  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  49.32 
 
 
299 aa  301  7.000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  43.2 
 
 
317 aa  246  4e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  38.8 
 
 
319 aa  218  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  36.61 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  37.5 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  36.03 
 
 
314 aa  209  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  41.13 
 
 
268 aa  209  6e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  37.87 
 
 
317 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  37.2 
 
 
309 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  34.35 
 
 
313 aa  186  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  38.24 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  34.55 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  31.85 
 
 
336 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  33.44 
 
 
333 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  32.44 
 
 
333 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  34.47 
 
 
302 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  33.67 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  48.46 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  37.58 
 
 
274 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  37.78 
 
 
247 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  45.26 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  49.59 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.33 
 
 
321 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.76 
 
 
314 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  27.84 
 
 
301 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  48.31 
 
 
300 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  42.22 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  43.18 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  50.88 
 
 
271 aa  114  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  50 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  49.14 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.03 
 
 
238 aa  112  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  41.67 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.37 
 
 
321 aa  112  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.65 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  42.15 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25170  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.61 
 
 
462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  48.25 
 
 
527 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  32.88 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  46.61 
 
 
312 aa  109  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  45.61 
 
 
274 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  46.49 
 
 
411 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  42.64 
 
 
301 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  41.35 
 
 
581 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  49.51 
 
 
414 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  40.44 
 
 
387 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  50.49 
 
 
402 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  45.45 
 
 
446 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  42.86 
 
 
271 aa  107  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  33.33 
 
 
400 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  47.93 
 
 
442 aa  106  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.37 
 
 
375 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.77 
 
 
423 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  46.96 
 
 
414 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  42.86 
 
 
325 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  29.93 
 
 
323 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  44.74 
 
 
471 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  45.3 
 
 
419 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  41.33 
 
 
524 aa  105  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  39.04 
 
 
324 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  40.15 
 
 
692 aa  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.63 
 
 
447 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  43.86 
 
 
490 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  33.51 
 
 
271 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  42.42 
 
 
529 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.63 
 
 
447 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  40.91 
 
 
577 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  40.15 
 
 
577 aa  104  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  43.86 
 
 
471 aa  104  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  40.46 
 
 
286 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.22 
 
 
372 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  43.59 
 
 
412 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  39.07 
 
 
676 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  38.41 
 
 
681 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  49.06 
 
 
375 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  43.7 
 
 
379 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  44.92 
 
 
265 aa  103  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  39.47 
 
 
325 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  34.06 
 
 
341 aa  103  4e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  30.4 
 
 
399 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  41.26 
 
 
651 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  36.59 
 
 
216 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  38.27 
 
 
455 aa  103  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  41.18 
 
 
491 aa  102  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  30.4 
 
 
399 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  44.35 
 
 
453 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.5 
 
 
431 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  42.86 
 
 
425 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  42.74 
 
 
523 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.62 
 
 
687 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  33.11 
 
 
454 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  44.14 
 
 
683 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  42.73 
 
 
347 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  43.85 
 
 
656 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  42.86 
 
 
425 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  40.87 
 
 
362 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>