More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1757 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  100 
 
 		 309 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  34.84 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  32.78 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  32.78 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  32.45 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  35.48 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.13 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.95 
 
 		 321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  35.19 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  47.27 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.32 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  40.61 
 
 		 375 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  55.74 
 
 		 400 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  56.56 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  56.45 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  56.56 
 
 		 404 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  55.28 
 
 		 375 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  55.28 
 
 		 430 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  35.64 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  50.4 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  38.87 
 
 		 373 aa  146  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.65 
 
 		 304 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  32.75 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  43.31 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  45.51 
 
 		 367 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  51.61 
 
 		 379 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  44.92 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  52.89 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  54.4 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  41.98 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  52.07 
 
 		 238 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  43.84 
 
 		 300 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  48 
 
 		 238 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  48.34 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.24 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  46.53 
 
 		 454 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  44.52 
 
 		 460 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  47.06 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  51.56 
 
 		 229 aa  135  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  39.05 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.24 
 
 		 376 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  45.26 
 
 		 414 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  55.74 
 
 		 541 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  33.81 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  43.36 
 
 		 415 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  44.38 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  31.21 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  52.46 
 
 		 582 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  51.22 
 
 		 441 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  42.07 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  42.51 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  31.37 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  48.8 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  45.24 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  32.68 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  41.15 
 
 		 374 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  42.14 
 
 		 303 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  35.71 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  47.06 
 
 		 455 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.29 
 
 		 399 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.33 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  33.33 
 
 		 321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  44.64 
 
 		 290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  47.62 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.29 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  47.06 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  28.99 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  47.01 
 
 		 446 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  51.26 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  47.79 
 
 		 453 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  33.33 
 
 		 445 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  43.75 
 
 		 288 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  47.06 
 
 		 459 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  44.78 
 
 		 442 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  45.08 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  45.45 
 
 		 457 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  41.4 
 
 		 372 aa  129  8.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  51.64 
 
 		 230 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  46.48 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  45.59 
 
 		 455 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  41.18 
 
 		 440 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  43.75 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  48.48 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  46.26 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  41.82 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  44.05 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  31.78 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.96 
 
 		 450 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  43.75 
 
 		 321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  42.14 
 
 		 391 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.57 
 
 		 443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  41.18 
 
 		 439 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  50.41 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  45.19 
 
 		 382 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  44.79 
 
 		 442 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  42.86 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  42.61 
 
 		 299 aa  125  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  40.71 
 
 		 392 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  42.03 
 
 		 247 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>