More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4836 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  100 
 
 
230 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  42.33 
 
 
320 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  54.78 
 
 
419 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.55 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  48.39 
 
 
301 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  56.2 
 
 
590 aa  129  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  38.19 
 
 
297 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  43.14 
 
 
283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  51.64 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  53.72 
 
 
824 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  40.11 
 
 
314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.57 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  39.42 
 
 
360 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  40.62 
 
 
430 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  37.36 
 
 
265 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  36.18 
 
 
274 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  45.26 
 
 
482 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  41.5 
 
 
376 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  51.24 
 
 
751 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  34.63 
 
 
452 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  48.36 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  35.89 
 
 
358 aa  119  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  50.43 
 
 
445 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.53 
 
 
375 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  42.25 
 
 
582 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  49.59 
 
 
402 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  40.41 
 
 
400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  43.41 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  36.77 
 
 
373 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.35 
 
 
375 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.11 
 
 
321 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  47.93 
 
 
231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  45.16 
 
 
523 aa  115  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  48.33 
 
 
349 aa  114  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  38.16 
 
 
300 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  42.65 
 
 
332 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  39.61 
 
 
404 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  36.51 
 
 
271 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  41.61 
 
 
303 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  36.51 
 
 
271 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  41.23 
 
 
308 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.75 
 
 
282 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.41 
 
 
375 aa  111  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  36.59 
 
 
316 aa  111  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  48.33 
 
 
727 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  48.33 
 
 
727 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  35.11 
 
 
300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  38.8 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  41.73 
 
 
334 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.9 
 
 
411 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  45 
 
 
399 aa  109  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  45 
 
 
399 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  42.42 
 
 
292 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  51.18 
 
 
468 aa  109  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  42.42 
 
 
294 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  40.69 
 
 
367 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  39.55 
 
 
377 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  46.34 
 
 
414 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  44.44 
 
 
312 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  50.43 
 
 
469 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  50.43 
 
 
469 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  40.77 
 
 
379 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  44.35 
 
 
374 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  46.55 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  47.93 
 
 
195 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  48.62 
 
 
323 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  42.42 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  47.9 
 
 
754 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  45.9 
 
 
198 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  43.41 
 
 
238 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  45.3 
 
 
186 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  45.9 
 
 
198 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  45.16 
 
 
284 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  40 
 
 
379 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  41.22 
 
 
469 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  44.09 
 
 
448 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.96 
 
 
288 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  36.7 
 
 
271 aa  107  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  34.01 
 
 
301 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  43.41 
 
 
238 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  41.55 
 
 
404 aa  106  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  43.7 
 
 
440 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  41.94 
 
 
379 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  43.8 
 
 
441 aa  106  4e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  44.44 
 
 
186 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  44.63 
 
 
402 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  50.43 
 
 
320 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  44.44 
 
 
229 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  40.79 
 
 
247 aa  105  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  43.42 
 
 
348 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  41.61 
 
 
456 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  41.77 
 
 
351 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  45.38 
 
 
296 aa  104  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  42.64 
 
 
374 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.98 
 
 
305 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  36.54 
 
 
305 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.98 
 
 
431 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  34.95 
 
 
278 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  36.54 
 
 
305 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  45.53 
 
 
299 aa  103  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>