More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0795 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  100 
 
 
316 aa  638    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  97.93 
 
 
290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  69.76 
 
 
328 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  66.34 
 
 
319 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  65.08 
 
 
330 aa  396  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  65.08 
 
 
327 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  52.48 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  48.22 
 
 
340 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  41.92 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  51.78 
 
 
310 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  41.97 
 
 
288 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  52.99 
 
 
321 aa  215  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  48.65 
 
 
288 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  51.5 
 
 
320 aa  207  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  50.43 
 
 
321 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  39.92 
 
 
318 aa  178  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  39.83 
 
 
313 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  37.05 
 
 
369 aa  169  6e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  37.05 
 
 
319 aa  169  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  34.94 
 
 
310 aa  161  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  38.5 
 
 
305 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  37.08 
 
 
299 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  38.01 
 
 
307 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  38.23 
 
 
307 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  36.25 
 
 
299 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  35.42 
 
 
299 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  34.34 
 
 
318 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  59.06 
 
 
394 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  34.15 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  34.58 
 
 
299 aa  146  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  49.69 
 
 
328 aa  145  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  42.25 
 
 
384 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  34.52 
 
 
315 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  37.14 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  48.72 
 
 
332 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  33.75 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  53.28 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  36.41 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  36.41 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  41.81 
 
 
391 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  36.67 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  35.94 
 
 
299 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  54.69 
 
 
415 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  33.74 
 
 
299 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  37.14 
 
 
299 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  37.14 
 
 
299 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  34.09 
 
 
299 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  37.14 
 
 
299 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  37.14 
 
 
299 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  51.64 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  53.79 
 
 
456 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  53.79 
 
 
455 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.93 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  52.27 
 
 
455 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  50.77 
 
 
430 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  52.31 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  52.27 
 
 
454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  53.03 
 
 
459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  53.38 
 
 
457 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  49.65 
 
 
392 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  36.02 
 
 
299 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  40.71 
 
 
306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  48.46 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  47.55 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  44.75 
 
 
392 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  52.67 
 
 
453 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  53.17 
 
 
411 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  51.91 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  50.39 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  44.05 
 
 
309 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40 
 
 
442 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  49.57 
 
 
305 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  49.57 
 
 
305 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  49.57 
 
 
305 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  55.46 
 
 
541 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  38.17 
 
 
296 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  32.34 
 
 
305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  33.68 
 
 
301 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  50.36 
 
 
382 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  51.72 
 
 
377 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  31.17 
 
 
292 aa  124  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  32.65 
 
 
313 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  50 
 
 
376 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  53.51 
 
 
243 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  30.03 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.88 
 
 
233 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  51.69 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  43.11 
 
 
440 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  50 
 
 
439 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  54.24 
 
 
379 aa  119  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  39.91 
 
 
452 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  30.07 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  46.46 
 
 
229 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  40.46 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.86 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  50.85 
 
 
413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  49.14 
 
 
374 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  52.54 
 
 
216 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  50.43 
 
 
377 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  51.75 
 
 
238 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>