More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0286 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  100 
 
 
374 aa  746    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  45.09 
 
 
374 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.72 
 
 
376 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  47.06 
 
 
372 aa  308  8e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  36.39 
 
 
379 aa  238  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.12 
 
 
377 aa  232  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  34.05 
 
 
379 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  31.5 
 
 
377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  33.51 
 
 
379 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  32.29 
 
 
375 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  35.71 
 
 
375 aa  206  7e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  33.67 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  31.79 
 
 
373 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  35.89 
 
 
400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  33.33 
 
 
402 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  36.25 
 
 
404 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  31.54 
 
 
412 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  31.34 
 
 
404 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  28.85 
 
 
399 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  28.57 
 
 
399 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  25.57 
 
 
431 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  31.46 
 
 
375 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  27.92 
 
 
441 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  28.57 
 
 
469 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  48.23 
 
 
265 aa  133  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  26.55 
 
 
397 aa  133  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  35.71 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  25.68 
 
 
397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36.4 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  49.61 
 
 
541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  44.9 
 
 
216 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  48.46 
 
 
430 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  52.5 
 
 
490 aa  129  8.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  31 
 
 
301 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  47.33 
 
 
324 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  49.15 
 
 
472 aa  126  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.1 
 
 
304 aa  126  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  49.57 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  46.58 
 
 
386 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  46.58 
 
 
386 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  49.57 
 
 
471 aa  125  1e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  24.31 
 
 
391 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  47.37 
 
 
446 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  32.26 
 
 
316 aa  123  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  36.01 
 
 
372 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  45.96 
 
 
386 aa  123  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  27.06 
 
 
378 aa  122  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  35.79 
 
 
271 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  44.26 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.48 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  46.09 
 
 
450 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  30.67 
 
 
361 aa  120  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  29.23 
 
 
300 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  34.96 
 
 
323 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  26.09 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  31.6 
 
 
414 aa  119  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  42.06 
 
 
262 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  48.33 
 
 
402 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  27.97 
 
 
448 aa  119  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  28.41 
 
 
378 aa  119  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  50.79 
 
 
271 aa  119  9e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.7 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  26.08 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  34.16 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.79 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  53.77 
 
 
687 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  50 
 
 
271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  38.37 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  45.52 
 
 
460 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  34.6 
 
 
308 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  29.8 
 
 
377 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  47.86 
 
 
527 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  45.67 
 
 
300 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.38 
 
 
446 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  34.07 
 
 
300 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  51.72 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  46.83 
 
 
274 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  48.72 
 
 
524 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  49.58 
 
 
238 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  29.87 
 
 
362 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  29.87 
 
 
362 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  30.19 
 
 
344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  48.33 
 
 
465 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  47.76 
 
 
290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  49.57 
 
 
415 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  49.18 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  46.83 
 
 
238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  29.87 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  45.52 
 
 
346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  40.48 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  46.83 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  33.48 
 
 
582 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  47.58 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  29.87 
 
 
362 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  33.18 
 
 
309 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  44.2 
 
 
529 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  50.44 
 
 
440 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  46.55 
 
 
429 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  50.44 
 
 
440 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.78 
 
 
445 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>