More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2292 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  100 
 
 
300 aa  623  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  72.76 
 
 
301 aa  474  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  58.67 
 
 
300 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  57.67 
 
 
299 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  36.96 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  36.96 
 
 
305 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  36.96 
 
 
305 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  38.04 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  35.74 
 
 
305 aa  195  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.54 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  35.32 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  31.78 
 
 
314 aa  148  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  35.93 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  50.78 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  29.56 
 
 
301 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  35.59 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  35.34 
 
 
376 aa  139  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  53.08 
 
 
387 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  32.57 
 
 
305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  52.34 
 
 
229 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  32.13 
 
 
323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.77 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  41.14 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.32 
 
 
343 aa  132  5e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  35.19 
 
 
340 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  29.53 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  42.47 
 
 
341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  50 
 
 
233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  33.33 
 
 
411 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  29.69 
 
 
310 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.96 
 
 
377 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  29.58 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  41.62 
 
 
305 aa  129  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  49.62 
 
 
238 aa  129  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  37.17 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  49.23 
 
 
402 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  32.86 
 
 
303 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  49.57 
 
 
527 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  36.69 
 
 
223 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  27.72 
 
 
323 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  45.53 
 
 
402 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  29.33 
 
 
325 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.1 
 
 
377 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  31.67 
 
 
372 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  42.42 
 
 
337 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  51.28 
 
 
524 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  44.44 
 
 
441 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  44.72 
 
 
375 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  48.15 
 
 
300 aa  123  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  33.2 
 
 
454 aa  123  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  47.33 
 
 
328 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.17 
 
 
399 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  44.17 
 
 
399 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  46.28 
 
 
431 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  30.18 
 
 
316 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  39.74 
 
 
247 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  34.14 
 
 
296 aa  122  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  34.11 
 
 
298 aa  122  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  28.94 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  44.17 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.86 
 
 
430 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  45.6 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  42.38 
 
 
384 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  44.36 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  44.2 
 
 
415 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  45.45 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  39.38 
 
 
296 aa  120  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.72 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  31.56 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  27.36 
 
 
318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  41.88 
 
 
299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  34.44 
 
 
450 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  31.1 
 
 
455 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  30 
 
 
325 aa  119  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  34.8 
 
 
313 aa  119  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  46.67 
 
 
300 aa  119  7e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  45.6 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  46.34 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  31.6 
 
 
341 aa  119  9e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  44.8 
 
 
271 aa  119  9e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  35.68 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.62 
 
 
404 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  44.26 
 
 
482 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.55 
 
 
375 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  44.09 
 
 
445 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  42.54 
 
 
392 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  37.95 
 
 
327 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  45.69 
 
 
423 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  32.1 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  33.01 
 
 
459 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  33.2 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  49.59 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  50 
 
 
490 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  44.83 
 
 
457 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  46.09 
 
 
394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  42.86 
 
 
382 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  45.6 
 
 
379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  43.8 
 
 
456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  44.63 
 
 
238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  43.2 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>