More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0243 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  100 
 
 		 300 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  60.47 
 
 		 301 aa  401  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  58.67 
 
 		 300 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  52.15 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  39.71 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  36.39 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  36.39 
 
 		 305 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.24 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  40.32 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.21 
 
 		 321 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  34.51 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  31.45 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  36.73 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  32.82 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.36 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  42.59 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.31 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  50.78 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.39 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  42.86 
 
 		 376 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  31.8 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  45.21 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  29.43 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  32.81 
 
 		 308 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  50.41 
 
 		 375 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  30.03 
 
 		 305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.79 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  34.69 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  35.16 
 
 		 340 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  48.87 
 
 		 417 aa  130  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  47.37 
 
 		 446 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.67 
 
 		 443 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.49 
 
 		 304 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  45.89 
 
 		 430 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  46.77 
 
 		 374 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  32.41 
 
 		 441 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  52.31 
 
 		 402 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  48.89 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  40.96 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  47.11 
 
 		 431 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  48.33 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  46.05 
 
 		 447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  46.05 
 
 		 447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  48.15 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  35.22 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  46.27 
 
 		 247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  30.26 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.4 
 
 		 372 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  46.15 
 
 		 445 aa  125  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  38.79 
 
 		 379 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  37.87 
 
 		 223 aa  125  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  47.26 
 
 		 384 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.3 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  40.23 
 
 		 460 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  29.8 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  45.6 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.76 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  43.66 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  33.22 
 
 		 300 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.24 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  39.13 
 
 		 402 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  32.14 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  28.71 
 
 		 299 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  33.6 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  33.69 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  43.29 
 
 		 491 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  31.56 
 
 		 341 aa  122  6e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  48.36 
 
 		 411 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  40.67 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  35.34 
 
 		 298 aa  122  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  46.67 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.81 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  38.69 
 
 		 377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  48.46 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  46.72 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  45.38 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  45.38 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  44.54 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  45.38 
 
 		 299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  29.23 
 
 		 374 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  32.2 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  29.3 
 
 		 332 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  44.27 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  47.93 
 
 		 238 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.44 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  45.38 
 
 		 299 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  45.26 
 
 		 412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  37.17 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  42.5 
 
 		 455 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  44.54 
 
 		 299 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50 
 
 		 453 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  48 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  44.54 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  44.54 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  44.54 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  44.54 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.57 
 
 		 229 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  44.54 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  29.29 
 
 		 325 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  46.96 
 
 		 459 aa  118  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>