More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2192 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  100 
 
 
296 aa  593  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  36.42 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  36.18 
 
 
315 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  37 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  36.12 
 
 
299 aa  147  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  36.12 
 
 
310 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  36.12 
 
 
299 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  33.01 
 
 
318 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  51.67 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  51.67 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  51.67 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  51.67 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  51.67 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  40 
 
 
304 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  50.83 
 
 
299 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  51.18 
 
 
445 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  36.93 
 
 
288 aa  139  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  50.83 
 
 
299 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  31.6 
 
 
292 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  50.83 
 
 
299 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  50.83 
 
 
299 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  50.83 
 
 
299 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  41.29 
 
 
453 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  32.87 
 
 
305 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  48.74 
 
 
298 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  54.7 
 
 
443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  42.79 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  50.41 
 
 
299 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  49.58 
 
 
299 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.64 
 
 
423 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  35.89 
 
 
305 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  50.42 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  41.05 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  35.91 
 
 
319 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  35.86 
 
 
299 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  31.91 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  35.45 
 
 
369 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  50.77 
 
 
387 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  37.63 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  35.14 
 
 
321 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  35.59 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  36.61 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.8 
 
 
455 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  35.91 
 
 
320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  39.08 
 
 
328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  35.69 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  42.94 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.21 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  40 
 
 
454 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  38.16 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  35.45 
 
 
313 aa  128  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  38.46 
 
 
288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  52 
 
 
400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  35.86 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  35.84 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  35.84 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  40.39 
 
 
459 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  41.38 
 
 
457 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  38.99 
 
 
455 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  35.27 
 
 
308 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  42.78 
 
 
340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  54.31 
 
 
402 aa  126  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  47.58 
 
 
375 aa  125  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  41.36 
 
 
404 aa  125  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  38.89 
 
 
456 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.15 
 
 
300 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  30.82 
 
 
308 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  50 
 
 
411 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  30.16 
 
 
300 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  48.28 
 
 
450 aa  123  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  43.18 
 
 
440 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  37.67 
 
 
447 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  37.67 
 
 
447 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  41.36 
 
 
382 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  41.48 
 
 
439 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  39.34 
 
 
327 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.5 
 
 
442 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  45.03 
 
 
415 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  38.65 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.91 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  50 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  35.98 
 
 
319 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  35.48 
 
 
310 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  30.94 
 
 
301 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  37.89 
 
 
306 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  51.79 
 
 
388 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  35.98 
 
 
446 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  45.26 
 
 
333 aa  119  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.75 
 
 
229 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  41.71 
 
 
328 aa  119  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  27.83 
 
 
301 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  47.58 
 
 
373 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  39.66 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.03 
 
 
238 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  35.03 
 
 
303 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  50.42 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  48.72 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  47.2 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  33.22 
 
 
299 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  35.59 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>