More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4455 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  46.84 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  47.18 
 
 		 299 aa  261  8e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  47.21 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  46.51 
 
 		 299 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  51.74 
 
 		 318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  46.18 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  43.73 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  44.55 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  43.52 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  44.19 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  44.19 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  43.85 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  44.04 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  44.04 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  44.04 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  51.09 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  44.04 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  48.48 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  51.53 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  43.05 
 
 		 299 aa  238  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  45.28 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  46.19 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  35.87 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  41.07 
 
 		 369 aa  185  8e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  40.36 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  41.07 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  39.32 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  39.21 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  37.18 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  37.18 
 
 		 320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  37.89 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  39.38 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  32.76 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  36.32 
 
 		 321 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  33.56 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  35.11 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  32.65 
 
 		 340 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  34.55 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  34.15 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  34.96 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  33.19 
 
 		 288 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  32.64 
 
 		 332 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  53.66 
 
 		 384 aa  138  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  33.04 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  48.74 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  32.44 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  39.62 
 
 		 332 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  39.74 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.19 
 
 		 443 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.65 
 
 		 454 aa  126  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  50.86 
 
 		 457 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.86 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  40.31 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  32.61 
 
 		 387 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.72 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  43.44 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  49.14 
 
 		 455 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  49.14 
 
 		 456 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  45.31 
 
 		 402 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.28 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  31.94 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  49.14 
 
 		 459 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  45.08 
 
 		 442 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.22 
 
 		 321 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.36 
 
 		 304 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  34.31 
 
 		 455 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  44.17 
 
 		 445 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  26.46 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.9 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  43.9 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.26 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  39.31 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  43.09 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  43.28 
 
 		 394 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.69 
 
 		 453 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  28.72 
 
 		 300 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  36.22 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.19 
 
 		 524 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  38.46 
 
 		 442 aa  113  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  41.53 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  47.37 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  38.27 
 
 		 299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  30.83 
 
 		 301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  44.17 
 
 		 388 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  32.86 
 
 		 450 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  36.26 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  45.6 
 
 		 233 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  34.81 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  36.67 
 
 		 303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  34.81 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  43.1 
 
 		 460 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  34.18 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  32.93 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  40.68 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  40.98 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  41.73 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  35.5 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  46.61 
 
 		 282 aa  109  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  41.8 
 
 		 459 aa  109  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>