More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3119 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  100 
 
 		 310 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  58.05 
 
 		 321 aa  316  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  56.04 
 
 		 321 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  54.66 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  45.83 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  45.7 
 
 		 328 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  50.75 
 
 		 290 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  51.78 
 
 		 316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  53.04 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  50.21 
 
 		 330 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  45.74 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  43.37 
 
 		 332 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  41.23 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  36.98 
 
 		 310 aa  208  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  45.49 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  46.46 
 
 		 288 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  36.66 
 
 		 318 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  38.43 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  37.78 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  38.31 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  41.52 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  38.69 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  39.72 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  39.76 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  35.37 
 
 		 318 aa  169  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.56 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  36.36 
 
 		 299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  38.25 
 
 		 299 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  35.21 
 
 		 299 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  48.66 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  33.8 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  33.68 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  35.04 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  37.84 
 
 		 299 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  37.84 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  37.84 
 
 		 299 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  37.63 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  37.84 
 
 		 299 aa  148  9e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  49.41 
 
 		 332 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  60.63 
 
 		 394 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  36.94 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  36.94 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  36.94 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  36.94 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  36.04 
 
 		 299 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  31.19 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  37.32 
 
 		 299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  34.8 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  40.38 
 
 		 423 aa  138  8.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  33.22 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  42.93 
 
 		 460 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  33.33 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  33.33 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  33.33 
 
 		 305 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  30.32 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  49.32 
 
 		 442 aa  135  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  51.61 
 
 		 399 aa  135  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.52 
 
 		 456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  47.8 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  49.03 
 
 		 415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  50.81 
 
 		 399 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  50.77 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  39.59 
 
 		 384 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  39.34 
 
 		 457 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  39.9 
 
 		 459 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  48.46 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  50 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  48.12 
 
 		 430 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  50.85 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  45.51 
 
 		 392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  52.14 
 
 		 430 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  40.96 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  45.22 
 
 		 391 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  44.87 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  54.31 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  50.86 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  34.52 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50.85 
 
 		 453 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  33.86 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.8 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  30.17 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  53.1 
 
 		 431 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  52.34 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  46.97 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  50 
 
 		 377 aa  123  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  45.04 
 
 		 445 aa  123  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.62 
 
 		 443 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  50.88 
 
 		 233 aa  123  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.41 
 
 		 442 aa  123  5e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  55.45 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  52.68 
 
 		 441 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  41.18 
 
 		 450 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  44.81 
 
 		 541 aa  122  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  47.33 
 
 		 238 aa  122  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  40.76 
 
 		 303 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  33.19 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  51.82 
 
 		 375 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  44.62 
 
 		 459 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  44.12 
 
 		 293 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  49.6 
 
 		 440 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>