More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4975 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4975  hypothetical protein  100 
 
 
307 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57240  hypothetical protein  97.07 
 
 
307 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.216005  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0930  peptidase M23B  62.3 
 
 
306 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0689854  normal  0.707751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  47 
 
 
310 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  41.99 
 
 
318 aa  252  6e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  43.18 
 
 
305 aa  235  9e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  45.39 
 
 
369 aa  225  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  45.39 
 
 
319 aa  225  9e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  44.21 
 
 
315 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  38.19 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  41.27 
 
 
318 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  37.22 
 
 
299 aa  211  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  40.82 
 
 
299 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  37.22 
 
 
299 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  43.93 
 
 
313 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  41.15 
 
 
299 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  40.82 
 
 
299 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  41.15 
 
 
299 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  41.15 
 
 
299 aa  205  7e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  41.15 
 
 
299 aa  205  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  39.76 
 
 
299 aa  205  9e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  41.15 
 
 
299 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  41.15 
 
 
299 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  40.74 
 
 
299 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  42.44 
 
 
299 aa  203  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  41.15 
 
 
299 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  41.15 
 
 
299 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.21 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  36.18 
 
 
305 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  41.03 
 
 
299 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  38.91 
 
 
328 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  36.69 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  38.69 
 
 
310 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  39.84 
 
 
330 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  38.01 
 
 
316 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  36.39 
 
 
327 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  37.83 
 
 
321 aa  170  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  35.74 
 
 
319 aa  168  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  40.79 
 
 
288 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  40.4 
 
 
290 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  39.43 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  37.17 
 
 
321 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  34.53 
 
 
340 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  34.59 
 
 
332 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  38.57 
 
 
288 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  40.98 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  42.48 
 
 
332 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  31.73 
 
 
301 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  35.59 
 
 
296 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.44 
 
 
321 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  54.46 
 
 
541 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  35.29 
 
 
384 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  39.25 
 
 
375 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  47.58 
 
 
430 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.57 
 
 
376 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  41.38 
 
 
442 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.19 
 
 
300 aa  123  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  42.77 
 
 
387 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.12 
 
 
445 aa  122  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  31.94 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  38.5 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.98 
 
 
399 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  49.21 
 
 
367 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  34.06 
 
 
423 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  31.29 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.98 
 
 
399 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  41.4 
 
 
394 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  50.33 
 
 
379 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  31.84 
 
 
305 aa  119  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  49.15 
 
 
468 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  34.31 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  36.46 
 
 
337 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  32.26 
 
 
325 aa  118  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.66 
 
 
442 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  47.41 
 
 
373 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  44.44 
 
 
527 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  38.75 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  46.27 
 
 
386 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  47.5 
 
 
377 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  45.45 
 
 
274 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  43.75 
 
 
656 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  47.24 
 
 
443 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  48.28 
 
 
439 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  44.93 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  30.32 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  42.41 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  37.27 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  43.9 
 
 
233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  45.65 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  33.2 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  48.28 
 
 
440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  34.18 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  50.91 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  47.06 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  34.65 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  39.23 
 
 
460 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  51.3 
 
 
238 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  42.62 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  40.62 
 
 
285 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>