More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001076 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  100 
 
 		 317 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  82.97 
 
 		 317 aa  551  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  59.05 
 
 		 313 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  56.23 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  46.59 
 
 		 336 aa  270  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  42.16 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  40.19 
 
 		 337 aa  258  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  38.36 
 
 		 333 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  38.63 
 
 		 333 aa  229  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  39.19 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  37.29 
 
 		 300 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  36.61 
 
 		 302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  36.95 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  37.5 
 
 		 317 aa  193  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  37.04 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  34.39 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  33 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  35.81 
 
 		 309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  36.48 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  36.02 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  47.17 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  46.67 
 
 		 286 aa  134  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  47.01 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  41.18 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  39.16 
 
 		 325 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  48.53 
 
 		 323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  39.29 
 
 		 524 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  44.2 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  41.38 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  39.16 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  34.01 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  42.19 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  45.53 
 
 		 569 aa  117  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  40.38 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.46 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  44.25 
 
 		 527 aa  116  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  48.72 
 
 		 458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.86 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  39.86 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  40.65 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  40.58 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  43.17 
 
 		 229 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  31.85 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  41.1 
 
 		 443 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  46.88 
 
 		 541 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.01 
 
 		 300 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  40.29 
 
 		 223 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  29.29 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  44.26 
 
 		 533 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  45.45 
 
 		 414 aa  108  8.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3225  peptidase M23B  48.33 
 
 		 443 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755339  normal  0.375504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  44.63 
 
 		 464 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.68 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  40.71 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  44.12 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  45.45 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.2 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  48.28 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  36.65 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  39.35 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  41.98 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40 
 
 		 491 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  32.35 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  45.97 
 
 		 490 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  41.86 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.8 
 
 		 375 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  47.86 
 
 		 550 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  46.96 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  46.96 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  46.96 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  43.18 
 
 		 305 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  47.41 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  40.15 
 
 		 301 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  43.18 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  45.3 
 
 		 431 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  45.3 
 
 		 431 aa  106  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  31.98 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  46.96 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  46.96 
 
 		 439 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.15 
 
 		 400 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  34.14 
 
 		 340 aa  106  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  42.15 
 
 		 421 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  47.11 
 
 		 419 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  46.96 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  46.96 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000497391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  42.19 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  46.96 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000737786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.15 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  46.96 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000317074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  46.96 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  46.96 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  46.96 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000381632  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  46.96 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  42.15 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  46.96 
 
 		 440 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000391864  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  41.67 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  45.61 
 
 		 491 aa  105  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  40.94 
 
 		 314 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  43.18 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  43.18 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>