More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004404 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  100 
 
 		 333 aa  694    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  87.39 
 
 		 333 aa  617  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  51.18 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  38.36 
 
 		 317 aa  231  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  39.31 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  36.83 
 
 		 314 aa  215  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  36.05 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  37.39 
 
 		 336 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  35.2 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  32.8 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  34.85 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  34.28 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  34.32 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  41.18 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  36.06 
 
 		 309 aa  169  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  32.44 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  35.74 
 
 		 268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  29.18 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  31.88 
 
 		 300 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  31.88 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  42.59 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  30.58 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  38.51 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  40.65 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  40.15 
 
 		 325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  35.84 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.37 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  32.25 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  44.44 
 
 		 457 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  42.86 
 
 		 454 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  44.44 
 
 		 457 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  44.44 
 
 		 457 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  31.02 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  41.1 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  41.84 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  44.54 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  42.86 
 
 		 450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  44.54 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  42.52 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  42.86 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  30.43 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  41.18 
 
 		 233 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  32.72 
 
 		 430 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.75 
 
 		 343 aa  113  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.27 
 
 		 321 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40.85 
 
 		 445 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  38.27 
 
 		 305 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  47.06 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  41.35 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  37.41 
 
 		 238 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.36 
 
 		 447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.36 
 
 		 447 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  36.11 
 
 		 274 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  48.72 
 
 		 524 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  32.95 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  40 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  37.41 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  35.44 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.09 
 
 		 569 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  38.86 
 
 		 323 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.69 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  37.5 
 
 		 446 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  34.07 
 
 		 377 aa  109  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  33.84 
 
 		 375 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  46.55 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  46.28 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  34.32 
 
 		 472 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  41.54 
 
 		 442 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  47.79 
 
 		 541 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  30.6 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  41.24 
 
 		 309 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  41.86 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  27.92 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  28.18 
 
 		 316 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  40.6 
 
 		 442 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  36.2 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  39.44 
 
 		 459 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  42.98 
 
 		 412 aa  106  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  27.92 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  47.37 
 
 		 443 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.43 
 
 		 321 aa  106  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  34.02 
 
 		 223 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  32.02 
 
 		 299 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  39.53 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.98 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.98 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  41.61 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  45.45 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  41.32 
 
 		 453 aa  105  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  35.97 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  42.15 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  38.82 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  42.98 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  44.88 
 
 		 490 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  42.98 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.1 
 
 		 527 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  33.9 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  29.2 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  43.22 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44.92 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>