More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00995 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  692    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  87.39 
 
 		 333 aa  617  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  51.04 
 
 		 337 aa  335  9e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  38.63 
 
 		 317 aa  229  7e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  40.19 
 
 		 317 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  37.78 
 
 		 314 aa  219  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  37.07 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  36.51 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  36.59 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  40.93 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  32.48 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  35.74 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  34.96 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  33.44 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  36.48 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  44.77 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  32.11 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  32.11 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  31.12 
 
 		 316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  29.51 
 
 		 296 aa  162  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  44.87 
 
 		 262 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  29.33 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  42.98 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  34.27 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  42.31 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  34.32 
 
 		 301 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  42.15 
 
 		 457 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  34.69 
 
 		 375 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  42.15 
 
 		 457 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  35.03 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  35.76 
 
 		 286 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  37.74 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  41.13 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  40.8 
 
 		 454 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.36 
 
 		 376 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  30.84 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.29 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  41.1 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.35 
 
 		 569 aa  110  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  32.71 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  40.5 
 
 		 345 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  40.5 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  29.66 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.03 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  46.9 
 
 		 541 aa  109  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  39.64 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  35.92 
 
 		 315 aa  109  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  42.11 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.83 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  33.95 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  36.14 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  42.98 
 
 		 412 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  39.46 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  37.5 
 
 		 233 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  40.91 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  39.2 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.2 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 		 300 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  42.42 
 
 		 442 aa  106  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.98 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.98 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  42.98 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  42.98 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.3 
 
 		 524 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  43.8 
 
 		 458 aa  106  7e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.54 
 
 		 321 aa  105  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  41.03 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  39.39 
 
 		 288 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  39.29 
 
 		 223 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  41.03 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  31.97 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  41.03 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  40.8 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  43.7 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  41.32 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  30.22 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  41.32 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  35.15 
 
 		 446 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  38.03 
 
 		 445 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  41.32 
 
 		 464 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  41.46 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  40.3 
 
 		 443 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  30.86 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.55 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.55 
 
 		 447 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  42.24 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  44.35 
 
 		 482 aa  103  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  30.95 
 
 		 423 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.11 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  32.54 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  29.82 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  41.88 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1270  Peptidase M23  39.42 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.71077  normal  0.529077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  32.44 
 
 		 299 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.17 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  37.98 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  41.6 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  31.84 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  40.65 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  40.65 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>