More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1544 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1544  peptidase M23B  100 
 
 		 336 aa  690    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  46.59 
 
 		 317 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1891  peptidase M23B  47.55 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  45.83 
 
 		 317 aa  286  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  44.74 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  38.92 
 
 		 337 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  38.82 
 
 		 302 aa  229  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  37.39 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  36.59 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  33.83 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 		 296 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  32.8 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  34.78 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  31.55 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  31.23 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  29.75 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  42.02 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  32.28 
 
 		 316 aa  162  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  43.95 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  35.43 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  41.04 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  32.74 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  45.58 
 
 		 286 aa  136  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  41.21 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  41.84 
 
 		 233 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  44.78 
 
 		 323 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  44.62 
 
 		 238 aa  125  8.000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  45.11 
 
 		 229 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  46.28 
 
 		 524 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  37.71 
 
 		 533 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  33.33 
 
 		 324 aa  122  8e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  45.16 
 
 		 569 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  46.15 
 
 		 312 aa  119  7e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  47.29 
 
 		 402 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  42.03 
 
 		 491 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  43.8 
 
 		 517 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  36.26 
 
 		 446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  42.28 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  29.89 
 
 		 441 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.18 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  38.16 
 
 		 447 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  38.16 
 
 		 447 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.97 
 
 		 527 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.46 
 
 		 399 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  38.85 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  43.26 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  41.13 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  43.26 
 
 		 468 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  38.46 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  42.06 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  42.74 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  38.71 
 
 		 464 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  35.75 
 
 		 430 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  42.75 
 
 		 475 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  42.62 
 
 		 687 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  42.75 
 
 		 473 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  29.21 
 
 		 431 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  42.75 
 
 		 473 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  39.38 
 
 		 430 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  42.65 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  40.28 
 
 		 690 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  43.31 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  40.58 
 
 		 429 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  36.6 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  42.62 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  39.55 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  42.75 
 
 		 475 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  42.62 
 
 		 676 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  40.43 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  30.99 
 
 		 491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  43.07 
 
 		 474 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  31.23 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  42.03 
 
 		 472 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  39.31 
 
 		 470 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  44.44 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  37.72 
 
 		 443 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  41.88 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  40.48 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  30.24 
 
 		 412 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  43.07 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  42.42 
 
 		 457 aa  109  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  33.61 
 
 		 550 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  45 
 
 		 458 aa  109  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  39.58 
 
 		 692 aa  109  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  39.72 
 
 		 465 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  41.94 
 
 		 615 aa  109  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  38.67 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  43.59 
 
 		 271 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  47.86 
 
 		 402 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  31.84 
 
 		 471 aa  109  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  30.86 
 
 		 430 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  44.27 
 
 		 651 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.28 
 
 		 420 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  41.8 
 
 		 680 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  44.54 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.03 
 
 		 503 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  39.85 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  41.94 
 
 		 621 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  34.3 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  39.16 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>