More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1882 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  100 
 
 		 430 aa  875    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  52.76 
 
 		 440 aa  458  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  52.42 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  46.33 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.92 
 
 		 450 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.75 
 
 		 423 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  39.17 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  37.5 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  37.71 
 
 		 459 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  36.64 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  36.1 
 
 		 455 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  34.98 
 
 		 455 aa  242  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.32 
 
 		 454 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  36.51 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  35.48 
 
 		 382 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  33.87 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  33.08 
 
 		 392 aa  190  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  34.02 
 
 		 414 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  29.14 
 
 		 445 aa  155  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  40.93 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  28.6 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  39.22 
 
 		 460 aa  153  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  39.53 
 
 		 402 aa  151  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  48.57 
 
 		 392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.29 
 
 		 442 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  50.7 
 
 		 229 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  57.26 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  54.2 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  31.26 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  31.26 
 
 		 447 aa  143  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  54.24 
 
 		 411 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  44.65 
 
 		 233 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  30.3 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  49.31 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  39.55 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  47.4 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  35.95 
 
 		 288 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.25 
 
 		 376 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  55.65 
 
 		 524 aa  136  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  52.17 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  42.22 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  48.03 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  49.62 
 
 		 330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  55.2 
 
 		 452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  50.77 
 
 		 316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  41.05 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  48.8 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.97 
 
 		 301 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  37.25 
 
 		 375 aa  134  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  36.63 
 
 		 491 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  43.41 
 
 		 290 aa  133  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  53.45 
 
 		 238 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  48.8 
 
 		 399 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  52.59 
 
 		 238 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.72 
 
 		 243 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  49.57 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  46.83 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  52.31 
 
 		 340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  50 
 
 		 412 aa  130  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  48.72 
 
 		 441 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  50.43 
 
 		 541 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  42.36 
 
 		 310 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  47.48 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  45.07 
 
 		 692 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  56.03 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  46.26 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  49.14 
 
 		 431 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  51.64 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  45.38 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  46.81 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  43.26 
 
 		 621 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  41.15 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  45.57 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  45.97 
 
 		 314 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  48.72 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  41.67 
 
 		 301 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.46 
 
 		 313 aa  126  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  27.47 
 
 		 443 aa  126  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  46.67 
 
 		 398 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  46.72 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  48.72 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  41.56 
 
 		 286 aa  125  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.87 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  39.87 
 
 		 305 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  43.61 
 
 		 238 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  41.83 
 
 		 327 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  50.86 
 
 		 527 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.87 
 
 		 305 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  45.83 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  33.33 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  48.44 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  37.89 
 
 		 288 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  34.35 
 
 		 299 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  52 
 
 		 582 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  42.67 
 
 		 328 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  47.01 
 
 		 305 aa  123  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  42.55 
 
 		 615 aa  123  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  48.46 
 
 		 321 aa  123  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  47.54 
 
 		 299 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  47.54 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>