More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2182 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  100 
 
 		 233 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  58.08 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50.79 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  52.85 
 
 		 569 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  44.65 
 
 		 430 aa  141  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  50 
 
 		 415 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  51.54 
 
 		 454 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  52.31 
 
 		 455 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  43.04 
 
 		 391 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  49.59 
 
 		 690 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  46.91 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  54.01 
 
 		 382 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  53.08 
 
 		 453 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  46.75 
 
 		 414 aa  136  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  47.01 
 
 		 392 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  41.77 
 
 		 392 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  45.18 
 
 		 459 aa  134  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  47.59 
 
 		 456 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  50.39 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  47.97 
 
 		 676 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  56.25 
 
 		 524 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  48.25 
 
 		 457 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  47.97 
 
 		 695 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  46.76 
 
 		 325 aa  132  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  49.23 
 
 		 455 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  46.34 
 
 		 680 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  52.42 
 
 		 527 aa  131  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  55.65 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  36.56 
 
 		 337 aa  131  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  50 
 
 		 300 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  48.78 
 
 		 692 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  45.53 
 
 		 681 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  43.03 
 
 		 402 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  47.26 
 
 		 442 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  48.51 
 
 		 286 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  45.64 
 
 		 340 aa  129  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  44.16 
 
 		 450 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  48.78 
 
 		 533 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.79 
 
 		 423 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  42.94 
 
 		 384 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  43.29 
 
 		 446 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  50 
 
 		 490 aa  127  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  49.62 
 
 		 301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  51.28 
 
 		 447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  48.85 
 
 		 324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  51.28 
 
 		 447 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  52.42 
 
 		 480 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  52.54 
 
 		 375 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  50 
 
 		 377 aa  125  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  40.24 
 
 		 445 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  52.17 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  52.68 
 
 		 238 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  50 
 
 		 503 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  48.85 
 
 		 387 aa  125  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  47.97 
 
 		 399 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  46.56 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  43.61 
 
 		 330 aa  124  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  47.97 
 
 		 399 aa  124  9e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0198  tagE protein  39.08 
 
 		 313 aa  124  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  50.43 
 
 		 376 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  46.81 
 
 		 332 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  47.66 
 
 		 313 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  39.74 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  50 
 
 		 474 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  50.81 
 
 		 468 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  46.34 
 
 		 346 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  47.15 
 
 		 310 aa  123  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  43.9 
 
 		 687 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  49.19 
 
 		 475 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  46.34 
 
 		 464 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  40.78 
 
 		 460 aa  123  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  50.81 
 
 		 447 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  45.99 
 
 		 383 aa  122  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  52 
 
 		 292 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  43.7 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  49.6 
 
 		 299 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  42.31 
 
 		 440 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  45.67 
 
 		 328 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  49.62 
 
 		 442 aa  122  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  40.41 
 
 		 317 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  50.78 
 
 		 328 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  49.59 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  47.69 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  48.39 
 
 		 473 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  49.19 
 
 		 475 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  46.53 
 
 		 439 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  51.26 
 
 		 271 aa  121  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  48.39 
 
 		 475 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  49.15 
 
 		 377 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  44.36 
 
 		 327 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  48.39 
 
 		 473 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  49.6 
 
 		 299 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  48.39 
 
 		 472 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  44.88 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  50 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2141  hypothetical protein  48.74 
 
 		 486 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.0000028881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  50.41 
 
 		 674 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  45.93 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  45.32 
 
 		 419 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  48.78 
 
 		 430 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>