More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2905 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  100 
 
 
375 aa  766    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  40.98 
 
 
375 aa  295  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  37.16 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  34.4 
 
 
373 aa  227  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  34.72 
 
 
379 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  34.57 
 
 
374 aa  215  8e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  34.9 
 
 
379 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  37.03 
 
 
377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.99 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  33.85 
 
 
379 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  32.29 
 
 
374 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  35.29 
 
 
372 aa  200  3e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  31.74 
 
 
399 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  31.99 
 
 
399 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  29.66 
 
 
411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  33.24 
 
 
404 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  30.36 
 
 
400 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.88 
 
 
404 aa  179  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  36.34 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  29.76 
 
 
412 aa  164  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  26.83 
 
 
431 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36.8 
 
 
305 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  40.61 
 
 
309 aa  152  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  25.68 
 
 
441 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  51.09 
 
 
541 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  29.52 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  26.42 
 
 
402 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.29 
 
 
301 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  57.63 
 
 
265 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  41.98 
 
 
282 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  51.97 
 
 
324 aa  138  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.68 
 
 
304 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  45 
 
 
482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  37.25 
 
 
430 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  32.95 
 
 
300 aa  133  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  48.63 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  53.6 
 
 
271 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  42.26 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  40.59 
 
 
328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  42.34 
 
 
423 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  51.69 
 
 
303 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  49.18 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  48.82 
 
 
687 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  51.61 
 
 
414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  52.07 
 
 
430 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  47.15 
 
 
301 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  47.83 
 
 
440 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  38.32 
 
 
452 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  54.31 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  52.17 
 
 
448 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  44 
 
 
367 aa  126  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  42.86 
 
 
523 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  48.82 
 
 
216 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  47.83 
 
 
439 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  46.26 
 
 
332 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  46.15 
 
 
582 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  50.82 
 
 
290 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  47.62 
 
 
262 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  49.19 
 
 
455 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  51.28 
 
 
598 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  47.97 
 
 
274 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  47.54 
 
 
414 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  45.76 
 
 
472 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  50 
 
 
538 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  44.72 
 
 
300 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  48.72 
 
 
308 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  31.4 
 
 
527 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50.43 
 
 
238 aa  123  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  47.41 
 
 
274 aa  123  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  50.42 
 
 
412 aa  123  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  50 
 
 
415 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  48.39 
 
 
524 aa  122  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  44.72 
 
 
247 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  50.42 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  46.4 
 
 
529 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  50.42 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  50.42 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  40.85 
 
 
412 aa  120  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  39.89 
 
 
324 aa  120  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  45.69 
 
 
460 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  46.77 
 
 
459 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  45.97 
 
 
456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.16 
 
 
453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  27.62 
 
 
394 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  46.67 
 
 
323 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  49.58 
 
 
420 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  35.21 
 
 
751 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.51 
 
 
468 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.83 
 
 
305 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.83 
 
 
305 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  47.86 
 
 
223 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  45.83 
 
 
305 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  53.04 
 
 
513 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  45.97 
 
 
455 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  45.69 
 
 
464 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  47.2 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  47.11 
 
 
321 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  46.28 
 
 
490 aa  118  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  43.31 
 
 
460 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  47.29 
 
 
243 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>