More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0935 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  100 
 
 		 598 aa  1238    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  40.99 
 
 		 580 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  35.63 
 
 		 735 aa  207  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  32.43 
 
 		 290 aa  137  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  33.92 
 
 		 346 aa  126  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  51.28 
 
 		 375 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  44.53 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  46.62 
 
 		 375 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  45.93 
 
 		 379 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  45.86 
 
 		 374 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  43.94 
 
 		 379 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  43.07 
 
 		 376 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  43.38 
 
 		 373 aa  107  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.73 
 
 		 430 aa  105  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.67 
 
 		 372 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  45.08 
 
 		 278 aa  105  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  47.9 
 
 		 374 aa  104  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  40.94 
 
 		 529 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  31.79 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  41.79 
 
 		 379 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  44 
 
 		 411 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40.74 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  45.38 
 
 		 216 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  40.29 
 
 		 377 aa  100  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  38.97 
 
 		 400 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  36.26 
 
 		 271 aa  99.4  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  42.22 
 
 		 249 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  41.1 
 
 		 271 aa  98.6  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  37.93 
 
 		 316 aa  98.2  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  40.41 
 
 		 271 aa  97.8  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  46.36 
 
 		 390 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  42.11 
 
 		 527 aa  97.8  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  42.86 
 
 		 475 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  38.81 
 
 		 274 aa  97.4  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  44.54 
 
 		 469 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  44.54 
 
 		 469 aa  97.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  36.05 
 
 		 324 aa  97.4  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  45.95 
 
 		 462 aa  97.1  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  46.15 
 
 		 321 aa  96.7  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  44.72 
 
 		 465 aa  96.7  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  44 
 
 		 457 aa  96.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40 
 
 		 404 aa  95.5  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  44.44 
 
 		 687 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  42.22 
 
 		 305 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  40.16 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  39.85 
 
 		 454 aa  95.1  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  36.67 
 
 		 412 aa  95.1  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  39.85 
 
 		 454 aa  95.1  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  41.33 
 
 		 412 aa  95.1  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3063  peptidase M23B  32.65 
 
 		 377 aa  94.4  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000502081  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0344  peptidase  39.53 
 
 		 347 aa  94.4  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.54 
 
 		 375 aa  94  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  39.85 
 
 		 460 aa  93.6  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  46.85 
 
 		 453 aa  93.6  9e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  42.03 
 
 		 414 aa  93.2  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.83 
 
 		 445 aa  93.6  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  45.05 
 
 		 454 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  37.59 
 
 		 404 aa  93.2  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  40.15 
 
 		 425 aa  93.2  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  42.5 
 
 		 319 aa  92.8  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  40.77 
 
 		 400 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  43.24 
 
 		 450 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  40 
 
 		 420 aa  92  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  39.39 
 
 		 425 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  40.77 
 
 		 421 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  45.05 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  40.3 
 
 		 402 aa  92  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  40.77 
 
 		 421 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  45.05 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  41.03 
 
 		 262 aa  91.7  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  45.05 
 
 		 265 aa  91.3  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  39.13 
 
 		 295 aa  91.3  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  44.14 
 
 		 446 aa  90.9  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  40 
 
 		 412 aa  90.9  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  35.29 
 
 		 442 aa  90.9  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  39.85 
 
 		 472 aa  90.5  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  39.85 
 
 		 471 aa  90.5  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  40.87 
 
 		 247 aa  90.1  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  33.33 
 
 		 225 aa  90.1  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  42.34 
 
 		 345 aa  90.1  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  44.64 
 
 		 223 aa  89.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  39.85 
 
 		 512 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  38.46 
 
 		 319 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  35.04 
 
 		 367 aa  89.7  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  40.6 
 
 		 470 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  39.85 
 
 		 509 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  38.97 
 
 		 305 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  38.97 
 
 		 305 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  38.24 
 
 		 449 aa  89.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  38.41 
 
 		 417 aa  89.4  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.54 
 
 		 386 aa  89  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  41.67 
 
 		 824 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  40.91 
 
 		 464 aa  89.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  42.54 
 
 		 386 aa  89  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  38.46 
 
 		 369 aa  88.6  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  38.97 
 
 		 305 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  36.81 
 
 		 751 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  38.02 
 
 		 282 aa  88.6  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  38.93 
 
 		 499 aa  88.2  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  40.48 
 
 		 324 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>