More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4308 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  79.21 
 
 
454 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  100 
 
 
457 aa  890    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  92.78 
 
 
457 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  92.78 
 
 
457 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  74.62 
 
 
450 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  83.14 
 
 
345 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  46.62 
 
 
400 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  48.41 
 
 
512 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  46.62 
 
 
420 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  48.24 
 
 
471 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  48.24 
 
 
472 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  44.9 
 
 
412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2447  M23/M37 familypeptidase  48.41 
 
 
499 aa  236  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.372819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1665  peptidase  48.24 
 
 
470 aa  235  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0321  metallopeptidase  48.24 
 
 
509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255107  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  46.9 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  46.55 
 
 
421 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  45.27 
 
 
425 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  45.27 
 
 
425 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  40.38 
 
 
454 aa  166  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  40.38 
 
 
454 aa  166  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  39.6 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  38.93 
 
 
464 aa  163  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.74 
 
 
446 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  38.67 
 
 
462 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  38.37 
 
 
453 aa  156  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  36.07 
 
 
465 aa  156  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  37.45 
 
 
460 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.94 
 
 
464 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  39.49 
 
 
457 aa  152  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  38.81 
 
 
464 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  36.89 
 
 
491 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  33.82 
 
 
569 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  39.83 
 
 
457 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.02 
 
 
687 aa  144  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  36.29 
 
 
490 aa  143  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  36.59 
 
 
465 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  36.33 
 
 
695 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  38.27 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  38.27 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  34.47 
 
 
441 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  36.65 
 
 
472 aa  137  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2163  Peptidase M23  35.39 
 
 
453 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36.21 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  43.48 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  31.02 
 
 
460 aa  133  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  32.79 
 
 
680 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  42.86 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  43.48 
 
 
386 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  31.5 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  30.66 
 
 
470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  35.46 
 
 
438 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  31.58 
 
 
681 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  33.06 
 
 
695 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  33.76 
 
 
465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  37.66 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  35.5 
 
 
741 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  34.52 
 
 
656 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  37.66 
 
 
475 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0247  M24/M37 family peptidase  33.7 
 
 
449 aa  127  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  37.66 
 
 
473 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2213  Peptidase M23  33.94 
 
 
457 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.987255  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  35.43 
 
 
621 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  37.23 
 
 
472 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  35.48 
 
 
490 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  32.8 
 
 
402 aa  127  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  33.7 
 
 
690 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  33.2 
 
 
676 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3011  peptidase M23B  36.56 
 
 
482 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.698295 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  32.79 
 
 
665 aa  126  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  32.89 
 
 
645 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  35.32 
 
 
312 aa  125  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  35.53 
 
 
475 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  40 
 
 
503 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  36.64 
 
 
480 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.83 
 
 
477 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  33.33 
 
 
692 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  33.68 
 
 
479 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  45.52 
 
 
412 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  34.94 
 
 
681 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  34.83 
 
 
674 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  32.44 
 
 
523 aa  124  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  35.63 
 
 
651 aa  123  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  32.45 
 
 
441 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  41.4 
 
 
577 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  35.02 
 
 
459 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05603  hypothetical protein  37.07 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  41.4 
 
 
577 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  30.08 
 
 
477 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  35.86 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  32.38 
 
 
683 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  32.71 
 
 
646 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  35.34 
 
 
474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  35.34 
 
 
475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  35.78 
 
 
503 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.29 
 
 
468 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  34.41 
 
 
615 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  32.95 
 
 
533 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  46.26 
 
 
362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  36.09 
 
 
464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>