More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1777 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1777  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
347 aa  720    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.193193  normal  0.0207649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  43.29 
 
 
354 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0085  Peptidase M23  45.26 
 
 
357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.869131 
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  42.18 
 
 
337 aa  169  5e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  33.94 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  47.15 
 
 
238 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00995  hypothetical protein  40.91 
 
 
333 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  45.08 
 
 
282 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  37.4 
 
 
300 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  35.86 
 
 
349 aa  106  5e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  48.15 
 
 
590 aa  106  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  43.2 
 
 
412 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  48.57 
 
 
352 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0655  putative membrane associated metallopeptidases  31.5 
 
 
337 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.964421  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  36.64 
 
 
300 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  40.54 
 
 
362 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  42.31 
 
 
420 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  40.46 
 
 
581 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  45.08 
 
 
270 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  50 
 
 
582 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  49.53 
 
 
358 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  45.97 
 
 
727 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  45.97 
 
 
727 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  42.73 
 
 
302 aa  102  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  39.5 
 
 
317 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  43.44 
 
 
414 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.4 
 
 
400 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 
754 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  41.54 
 
 
421 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  42.5 
 
 
399 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  42.5 
 
 
399 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  41.54 
 
 
421 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  41.61 
 
 
669 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  46.67 
 
 
318 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.21 
 
 
321 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  46.02 
 
 
297 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  46.73 
 
 
824 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  44.26 
 
 
402 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  40.34 
 
 
317 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  36.42 
 
 
283 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  44.17 
 
 
293 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  43.27 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  48.6 
 
 
482 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  42.86 
 
 
195 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  43.8 
 
 
352 aa  99  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  40.77 
 
 
425 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.65 
 
 
303 aa  99  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  46.15 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  45.54 
 
 
468 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1036  metalloprotease  46.94 
 
 
458 aa  99  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193125  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  47.86 
 
 
491 aa  98.6  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  44.44 
 
 
269 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  50 
 
 
323 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  42.28 
 
 
388 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  47.37 
 
 
751 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  45.6 
 
 
285 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  45.22 
 
 
527 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  46.72 
 
 
288 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  42.28 
 
 
425 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  34.07 
 
 
569 aa  97.4  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  42.75 
 
 
447 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  42.75 
 
 
447 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  42.62 
 
 
283 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  41.88 
 
 
237 aa  96.7  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  42.64 
 
 
541 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  44.55 
 
 
325 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  44.17 
 
 
313 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  37.82 
 
 
302 aa  96.7  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  42.31 
 
 
387 aa  96.3  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  41.75 
 
 
299 aa  96.3  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  50.49 
 
 
231 aa  95.9  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  44.35 
 
 
316 aa  96.3  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  41.13 
 
 
482 aa  95.9  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  45.54 
 
 
455 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  43.31 
 
 
268 aa  96.3  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.93 
 
 
312 aa  95.9  9e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  33.33 
 
 
460 aa  95.9  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  38.93 
 
 
465 aa  95.9  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  42.74 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1203  peptidase M23B  34.59 
 
 
204 aa  95.1  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000001941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  47.37 
 
 
376 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  40.46 
 
 
457 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  45.3 
 
 
524 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.41 
 
 
423 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  42.42 
 
 
360 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3948  peptidase M23B  43.7 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.703848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1828  hypothetical protein  47.92 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000168261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.09 
 
 
375 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  44.23 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  37.89 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  44 
 
 
412 aa  94.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  44.04 
 
 
320 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2112  hypothetical protein  47.92 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000011239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  41.88 
 
 
236 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  49.53 
 
 
448 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  45.13 
 
 
453 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  46.43 
 
 
391 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  39.68 
 
 
437 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  41.46 
 
 
273 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  40.15 
 
 
446 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>