More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1457 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  100 
 
 
241 aa  481  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3330  Peptidase M23  43.53 
 
 
256 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0172603  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  44.69 
 
 
304 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1947  Peptidase M23  44.05 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.653444  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  42.02 
 
 
274 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  33.77 
 
 
363 aa  104  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  28.57 
 
 
249 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  39.29 
 
 
291 aa  102  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  36.31 
 
 
423 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  37.18 
 
 
265 aa  99  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  41.13 
 
 
430 aa  99  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  40.32 
 
 
411 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  44.17 
 
 
376 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  42.02 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  35.95 
 
 
301 aa  95.9  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  44.07 
 
 
402 aa  95.5  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  41.03 
 
 
538 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  39.67 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  44.72 
 
 
372 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  35.86 
 
 
441 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  42.86 
 
 
374 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  35.26 
 
 
523 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  41.28 
 
 
288 aa  94  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  39.67 
 
 
271 aa  94  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  38.76 
 
 
399 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.02 
 
 
314 aa  93.2  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  40 
 
 
377 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  37.29 
 
 
271 aa  92.8  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  43.09 
 
 
370 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  36.75 
 
 
285 aa  92  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  32.24 
 
 
295 aa  92  8e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  32.14 
 
 
324 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  43.9 
 
 
373 aa  91.7  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  37.98 
 
 
399 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  37.86 
 
 
404 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  39.67 
 
 
375 aa  91.3  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  43.9 
 
 
372 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  38.89 
 
 
352 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  33.61 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  37.4 
 
 
327 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.16 
 
 
524 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  34.62 
 
 
529 aa  89.7  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  38.89 
 
 
238 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  39.68 
 
 
431 aa  89.7  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  40.74 
 
 
319 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  34.45 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  37.82 
 
 
316 aa  89.4  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  32.67 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  40 
 
 
293 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  38.89 
 
 
238 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  41.13 
 
 
316 aa  89  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  37.4 
 
 
373 aa  88.6  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  39.67 
 
 
297 aa  88.6  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  36.94 
 
 
324 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  35.34 
 
 
315 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.66 
 
 
321 aa  87.8  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  38.81 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  40.35 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  39.32 
 
 
305 aa  87.8  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  30.58 
 
 
442 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  42.02 
 
 
374 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  40.94 
 
 
186 aa  88.2  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  38.39 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  33.33 
 
 
330 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  41.13 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  36.36 
 
 
1019 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  40.18 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  37.98 
 
 
340 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  41.82 
 
 
464 aa  87.4  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  39.47 
 
 
460 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  34.42 
 
 
247 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  41.38 
 
 
186 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  40.17 
 
 
610 aa  86.3  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  37.5 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  38.98 
 
 
278 aa  86.3  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  43.33 
 
 
400 aa  86.3  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  40.17 
 
 
305 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  42.02 
 
 
334 aa  86.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  36.59 
 
 
323 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.19 
 
 
309 aa  86.3  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  39.64 
 
 
480 aa  85.9  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  39.32 
 
 
305 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  39.32 
 
 
305 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  34.71 
 
 
301 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  36.75 
 
 
274 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.53 
 
 
321 aa  85.5  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  36.36 
 
 
325 aa  85.9  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  30.04 
 
 
244 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  38.28 
 
 
308 aa  85.5  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  34.29 
 
 
307 aa  85.5  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  32.32 
 
 
430 aa  85.5  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  36.72 
 
 
400 aa  85.5  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.74 
 
 
372 aa  85.5  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  40.71 
 
 
390 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  36.43 
 
 
541 aa  85.5  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  44.44 
 
 
414 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  38.84 
 
 
388 aa  85.1  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  39.25 
 
 
475 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  33.12 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  40.34 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>