More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2424 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  100 
 
 		 610 aa  1185    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  50.56 
 
 		 605 aa  213  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  50.48 
 
 		 388 aa  207  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  55.56 
 
 		 560 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  54.47 
 
 		 238 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  54.47 
 
 		 243 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  54.47 
 
 		 238 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  34.12 
 
 		 274 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  48.44 
 
 		 186 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  40.65 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  44.44 
 
 		 314 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  47.11 
 
 		 430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  42.37 
 
 		 375 aa  118  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  46.67 
 
 		 271 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  48.21 
 
 		 412 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  47.66 
 
 		 186 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  47.75 
 
 		 247 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  44.74 
 
 		 411 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  45 
 
 		 271 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  43.2 
 
 		 377 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  41.03 
 
 		 282 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  41.13 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  51.43 
 
 		 299 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  56.84 
 
 		 197 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  42.06 
 
 		 301 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  45.38 
 
 		 319 aa  114  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  46.96 
 
 		 299 aa  113  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  44.54 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  43.8 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  47.41 
 
 		 367 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.98 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  41.94 
 
 		 216 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.98 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  42.15 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  44.07 
 
 		 299 aa  111  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  45.38 
 
 		 369 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  47.83 
 
 		 299 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  40.97 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  45.97 
 
 		 318 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  41.67 
 
 		 295 aa  111  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  45.22 
 
 		 299 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  50.48 
 
 		 318 aa  111  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  41.29 
 
 		 291 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.75 
 
 		 309 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  45.08 
 
 		 333 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  45.53 
 
 		 294 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  40.98 
 
 		 404 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  48.7 
 
 		 295 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  44.53 
 
 		 541 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  42 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  46.55 
 
 		 310 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  49.52 
 
 		 299 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  45.53 
 
 		 292 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  42.75 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  48.62 
 
 		 241 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  41.53 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  44 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  41.96 
 
 		 265 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  41.98 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  47.62 
 
 		 184 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  45.61 
 
 		 582 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  45.04 
 
 		 240 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.55 
 
 		 304 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  41.67 
 
 		 271 aa  108  4e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  42.06 
 
 		 459 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.41 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  44.92 
 
 		 299 aa  107  5e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  46.72 
 
 		 284 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  41.38 
 
 		 375 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  48.15 
 
 		 247 aa  107  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.3 
 
 		 328 aa  107  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  42.74 
 
 		 376 aa  107  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  44.92 
 
 		 299 aa  106  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  46.09 
 
 		 299 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  44.92 
 
 		 299 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  44.54 
 
 		 358 aa  106  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  45.54 
 
 		 296 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.48 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  40.77 
 
 		 288 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  44.92 
 
 		 299 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  44.92 
 
 		 299 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  42.06 
 
 		 456 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  45.61 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  45 
 
 		 192 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  42.86 
 
 		 305 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  41.13 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  45.83 
 
 		 284 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  42.98 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  48.6 
 
 		 199 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  41.27 
 
 		 457 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  38.46 
 
 		 443 aa  104  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  45.3 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  43.86 
 
 		 293 aa  104  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  46.73 
 
 		 198 aa  104  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.97 
 
 		 375 aa  104  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  45.76 
 
 		 292 aa  104  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  47.58 
 
 		 251 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.7 
 
 		 372 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  45.16 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  47 
 
 		 404 aa  103  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>