More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2376 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  90.32 
 
 		 186 aa  337  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  60.34 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  54.91 
 
 		 192 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  48.55 
 
 		 198 aa  151  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  61.26 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  53.19 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  54.78 
 
 		 301 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  55.17 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  55.26 
 
 		 273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  56.67 
 
 		 252 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  51.64 
 
 		 605 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  48.44 
 
 		 610 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  55.17 
 
 		 194 aa  121  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  49.61 
 
 		 247 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  56.36 
 
 		 285 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  49.18 
 
 		 430 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.13 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  50.89 
 
 		 388 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  49.62 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  48.82 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44.54 
 
 		 274 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  47.83 
 
 		 314 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.46 
 
 		 375 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.87 
 
 		 238 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  47.79 
 
 		 334 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.32 
 
 		 304 aa  112  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  45.9 
 
 		 363 aa  112  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  51.3 
 
 		 321 aa  111  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  54.35 
 
 		 419 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  50.43 
 
 		 299 aa  110  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  46.49 
 
 		 324 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  47.46 
 
 		 417 aa  109  2.0000000000000002e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  46.58 
 
 		 328 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  49.57 
 
 		 292 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  45.3 
 
 		 230 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  40.77 
 
 		 377 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  52.73 
 
 		 442 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  50.45 
 
 		 299 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  48.7 
 
 		 299 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  50 
 
 		 299 aa  105  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  45.54 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  47.83 
 
 		 305 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  45.54 
 
 		 271 aa  104  6e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  42.37 
 
 		 411 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  43.33 
 
 		 265 aa  104  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  48.65 
 
 		 299 aa  104  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  49.54 
 
 		 313 aa  104  8e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  39.02 
 
 		 249 aa  104  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  46.96 
 
 		 305 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  46.96 
 
 		 305 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  44.74 
 
 		 308 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  45.3 
 
 		 358 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  44.7 
 
 		 323 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.72 
 
 		 590 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  47.27 
 
 		 367 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  45.87 
 
 		 223 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  43.44 
 
 		 824 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  49.55 
 
 		 299 aa  103  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  44.26 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  52.29 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  45.22 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  48.65 
 
 		 299 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  48.7 
 
 		 318 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  45.22 
 
 		 298 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  47.01 
 
 		 299 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  45.69 
 
 		 316 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  48.78 
 
 		 453 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  46.15 
 
 		 332 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  48.15 
 
 		 300 aa  102  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  47.97 
 
 		 348 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  44.26 
 
 		 582 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  46.36 
 
 		 321 aa  102  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  48.18 
 
 		 387 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  46.9 
 
 		 333 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  48.39 
 
 		 455 aa  102  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  41.38 
 
 		 332 aa  101  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  47.01 
 
 		 299 aa  101  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  48.39 
 
 		 454 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  50 
 
 		 320 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.72 
 
 		 491 aa  101  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  47.01 
 
 		 299 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  47.01 
 
 		 299 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  47.01 
 
 		 299 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.25 
 
 		 303 aa  101  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  42.37 
 
 		 404 aa  100  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  46.15 
 
 		 394 aa  100  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  44.35 
 
 		 310 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  48.25 
 
 		 323 aa  100  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  47.27 
 
 		 460 aa  100  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  47.11 
 
 		 351 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  44.25 
 
 		 300 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  50.47 
 
 		 293 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  43.9 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39.82 
 
 		 282 aa  99.8  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  45.54 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  41.59 
 
 		 317 aa  99.8  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  45.95 
 
 		 319 aa  99.8  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  47.37 
 
 		 415 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  47.5 
 
 		 445 aa  99.8  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>