More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3764 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  63.24 
 
 
198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  57.24 
 
 
199 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  56.55 
 
 
251 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  46.5 
 
 
184 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  55.17 
 
 
186 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  54.31 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  54.63 
 
 
301 aa  119  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  58.49 
 
 
247 aa  118  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  54.55 
 
 
265 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  52.78 
 
 
334 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  50 
 
 
192 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  52.94 
 
 
303 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  51.69 
 
 
238 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  47.83 
 
 
440 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  49.25 
 
 
439 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  52.94 
 
 
452 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  50.85 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  55.26 
 
 
252 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  49.11 
 
 
459 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  50.47 
 
 
316 aa  108  6e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  53.1 
 
 
442 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  55.24 
 
 
321 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  51.75 
 
 
423 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  51.43 
 
 
273 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  49.59 
 
 
243 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  52.83 
 
 
411 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  49.12 
 
 
313 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  50.93 
 
 
375 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  51.79 
 
 
388 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  49.11 
 
 
490 aa  106  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  49.07 
 
 
363 aa  105  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  43.84 
 
 
308 aa  105  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  49.52 
 
 
308 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  49.18 
 
 
430 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  50.45 
 
 
238 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  48.65 
 
 
387 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  45.95 
 
 
318 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  47.37 
 
 
450 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  50 
 
 
285 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  43.18 
 
 
315 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  49.12 
 
 
241 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  47.5 
 
 
299 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  50.47 
 
 
430 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  45.6 
 
 
384 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  55.24 
 
 
453 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  46.15 
 
 
310 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  44.2 
 
 
328 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  47.62 
 
 
300 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  50 
 
 
318 aa  102  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  48.67 
 
 
299 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  46.34 
 
 
374 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  49.07 
 
 
271 aa  101  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  48.15 
 
 
376 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  48.21 
 
 
377 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  47.93 
 
 
447 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  50.91 
 
 
332 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  47.93 
 
 
447 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  46.73 
 
 
312 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.96 
 
 
442 aa  99.8  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  49.53 
 
 
305 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  47.79 
 
 
299 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  50.41 
 
 
240 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  49.53 
 
 
305 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  52.38 
 
 
455 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  46.9 
 
 
446 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0778  Peptidase M23  47.01 
 
 
305 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  52 
 
 
402 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  49.53 
 
 
305 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  49.56 
 
 
299 aa  99.8  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  49.06 
 
 
247 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  46.85 
 
 
292 aa  99.8  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  54 
 
 
456 aa  99.4  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  51.4 
 
 
305 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  47.66 
 
 
309 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  50.93 
 
 
582 aa  99  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  52.38 
 
 
454 aa  99  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04760  putative peptidase  46.15 
 
 
325 aa  99  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  46.9 
 
 
299 aa  98.6  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  51.89 
 
 
468 aa  98.6  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  47.79 
 
 
299 aa  98.2  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  49.09 
 
 
313 aa  98.6  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  42.95 
 
 
352 aa  98.2  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  46.43 
 
 
372 aa  98.2  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  49.53 
 
 
824 aa  98.2  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  47.37 
 
 
293 aa  97.8  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  49.53 
 
 
282 aa  97.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  48.6 
 
 
324 aa  97.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  46.43 
 
 
314 aa  97.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  48.11 
 
 
248 aa  97.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  43.9 
 
 
374 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  43.86 
 
 
305 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  46.15 
 
 
323 aa  97.1  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  46.67 
 
 
445 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  53 
 
 
459 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  53 
 
 
455 aa  97.1  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  52.63 
 
 
491 aa  97.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  35.26 
 
 
316 aa  97.1  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  47.01 
 
 
324 aa  96.7  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  46.02 
 
 
299 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>