More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1837 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  100 
 
 		 252 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  55.87 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  45.38 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  45.49 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  45.08 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  44.16 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  46.31 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  56.67 
 
 		 186 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  55 
 
 		 186 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  49.26 
 
 		 605 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.54 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  56.88 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  55.96 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  39.27 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  52.99 
 
 		 184 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  50.44 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  44.37 
 
 		 388 aa  111  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  52.25 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  53.64 
 
 		 468 aa  109  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  55.26 
 
 		 194 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  39.72 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  50 
 
 		 198 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48.18 
 
 		 314 aa  106  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  41.18 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  48.09 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  52.34 
 
 		 411 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  53.27 
 
 		 430 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  52.38 
 
 		 199 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  54.63 
 
 		 824 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  48.25 
 
 		 419 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  47.83 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  45.22 
 
 		 282 aa  104  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  46.15 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  41.67 
 
 		 610 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  49.15 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  49.23 
 
 		 294 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  42.75 
 
 		 369 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  47.22 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  50.41 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  49.18 
 
 		 324 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  46.96 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  34.81 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  48.46 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  50.98 
 
 		 216 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  51.35 
 
 		 291 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  42.5 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  48.15 
 
 		 309 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  51.24 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  47.83 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  51.22 
 
 		 195 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  42.76 
 
 		 517 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  52.54 
 
 		 727 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  50.41 
 
 		 198 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  52.54 
 
 		 727 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  46.96 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  46.09 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  46.96 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  46.96 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  46.96 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  42.03 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  46.09 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  46.96 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  46.96 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  43.8 
 
 		 446 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  46.28 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  46.96 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  41.18 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  46.96 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  51.89 
 
 		 374 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  48.31 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  50.81 
 
 		 590 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  46.34 
 
 		 334 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  47.15 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  49.04 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  46.49 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  49.17 
 
 		 524 aa  99.8  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  50.46 
 
 		 375 aa  99.8  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  43.51 
 
 		 459 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  42.34 
 
 		 308 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  52.25 
 
 		 192 aa  99.8  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  44.54 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  50.93 
 
 		 320 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  46.49 
 
 		 299 aa  99.4  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 754 aa  99  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  45.45 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  47.79 
 
 		 465 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  43.06 
 
 		 457 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  45.05 
 
 		 318 aa  98.2  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  52.78 
 
 		 751 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  48.08 
 
 		 313 aa  98.2  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  50.46 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  47.27 
 
 		 291 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  46.73 
 
 		 379 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  43.06 
 
 		 457 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  49.09 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  47.27 
 
 		 527 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  43.38 
 
 		 316 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  46.02 
 
 		 452 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  34.2 
 
 		 441 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  35.33 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>