More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0237 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  100 
 
 
824 aa  1689    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  64.77 
 
 
590 aa  247  6.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  67.11 
 
 
751 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  66.23 
 
 
727 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  66.23 
 
 
727 aa  241  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  39.33 
 
 
754 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  60.13 
 
 
788 aa  201  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  63.5 
 
 
195 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  64.18 
 
 
511 aa  188  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  54.37 
 
 
333 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  58.7 
 
 
198 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  57.97 
 
 
198 aa  181  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  58.62 
 
 
349 aa  180  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  61.6 
 
 
358 aa  174  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  61.11 
 
 
360 aa  171  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  49.06 
 
 
452 aa  155  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  50.71 
 
 
482 aa  144  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  52.85 
 
 
348 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  52.03 
 
 
351 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  52.76 
 
 
333 aa  141  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  53.66 
 
 
284 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  48.15 
 
 
582 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  52.94 
 
 
294 aa  131  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  49.62 
 
 
274 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  52.94 
 
 
291 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  52.1 
 
 
292 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  47.33 
 
 
419 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  54.03 
 
 
301 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  53.72 
 
 
230 aa  129  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  48.41 
 
 
458 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  45.88 
 
 
265 aa  128  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  50.39 
 
 
339 aa  127  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  52.99 
 
 
468 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  49.59 
 
 
339 aa  126  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  51.97 
 
 
411 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  47.15 
 
 
360 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  47.15 
 
 
360 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  47.15 
 
 
360 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  48.03 
 
 
340 aa  124  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  48.03 
 
 
340 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  49.59 
 
 
340 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  48.78 
 
 
334 aa  124  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  50 
 
 
326 aa  124  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  52.25 
 
 
491 aa  124  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  50.78 
 
 
379 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  52.03 
 
 
445 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  44.6 
 
 
297 aa  122  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  50.42 
 
 
443 aa  121  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  49.61 
 
 
309 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  53.51 
 
 
430 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  51.59 
 
 
402 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2761  peptidase M23  50.35 
 
 
529 aa  120  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.758494  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  48.33 
 
 
442 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  49.18 
 
 
494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  47.58 
 
 
305 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  48.03 
 
 
350 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  53.04 
 
 
269 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.41 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  48.57 
 
 
320 aa  119  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.42 
 
 
375 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  48.09 
 
 
314 aa  118  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  52.34 
 
 
466 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  50 
 
 
350 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  47.37 
 
 
376 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  48.06 
 
 
537 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  47.66 
 
 
271 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  48.36 
 
 
501 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  45.38 
 
 
367 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  35.21 
 
 
402 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  37.39 
 
 
324 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  50 
 
 
414 aa  116  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  47.5 
 
 
288 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  47.15 
 
 
332 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  51.26 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  50.48 
 
 
354 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  46.38 
 
 
402 aa  115  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  50.42 
 
 
527 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  52.07 
 
 
523 aa  115  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  48.76 
 
 
406 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.62 
 
 
304 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  42.07 
 
 
417 aa  114  6e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  42.47 
 
 
375 aa  114  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  48 
 
 
273 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  47.06 
 
 
445 aa  114  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  46.92 
 
 
271 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  46.51 
 
 
399 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  48.74 
 
 
648 aa  114  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  46.15 
 
 
271 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  46.88 
 
 
441 aa  114  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  43.8 
 
 
471 aa  114  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  45.26 
 
 
404 aa  114  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  47.93 
 
 
224 aa  114  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  48.41 
 
 
247 aa  114  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  47.06 
 
 
446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  51.79 
 
 
469 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  46.03 
 
 
375 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  44.63 
 
 
484 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  51.28 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  49.17 
 
 
446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  43.8 
 
 
449 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>