More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1283 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  75 
 
 		 320 aa  208  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  53.63 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  47.09 
 
 		 272 aa  171  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  53.71 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  51.83 
 
 		 326 aa  161  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  58.68 
 
 		 406 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  60.31 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  60.47 
 
 		 458 aa  158  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  53.33 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  45.23 
 
 		 360 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  45.23 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  50.66 
 
 		 339 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  45.23 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  55.3 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  50 
 
 		 339 aa  142  6e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  43.22 
 
 		 351 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  49.34 
 
 		 340 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  43.14 
 
 		 348 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  44.38 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  50 
 
 		 340 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  39.32 
 
 		 334 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  50 
 
 		 340 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  51.91 
 
 		 199 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  45.1 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  54.62 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  50.71 
 
 		 346 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  46.58 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  44.25 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  48.84 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  51.3 
 
 		 452 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  49.57 
 
 		 590 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  36.25 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  37.35 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  51.28 
 
 		 824 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.65 
 
 		 751 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  51.82 
 
 		 727 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  50.83 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  51.82 
 
 		 727 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  45.86 
 
 		 383 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  44.44 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  38.46 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  45.97 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.72 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  45.53 
 
 		 491 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  50 
 
 		 195 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  45.16 
 
 		 754 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  46.09 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.19 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.19 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  46.55 
 
 		 349 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  43.18 
 
 		 419 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  33.61 
 
 		 231 aa  105  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  43.17 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  43.26 
 
 		 311 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  43.2 
 
 		 367 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  51.26 
 
 		 414 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  45.19 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  46.46 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  43.41 
 
 		 446 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  43.65 
 
 		 360 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  44.35 
 
 		 569 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.8 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  41.77 
 
 		 402 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  45.67 
 
 		 414 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  47.06 
 
 		 511 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  42.57 
 
 		 424 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  45.67 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  49.17 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  49.59 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  45.67 
 
 		 421 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  46.51 
 
 		 271 aa  99.4  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  44.26 
 
 		 465 aa  99.4  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  44.62 
 
 		 462 aa  99  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  45.83 
 
 		 273 aa  99  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.77 
 
 		 274 aa  98.6  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  48.67 
 
 		 251 aa  98.6  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  43.7 
 
 		 266 aa  98.6  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  40.82 
 
 		 323 aa  97.8  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  44.25 
 
 		 603 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  41.32 
 
 		 332 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  44.25 
 
 		 603 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  45.67 
 
 		 417 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  45.67 
 
 		 423 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  45.67 
 
 		 423 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  45.67 
 
 		 423 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  45.67 
 
 		 417 aa  97.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  50 
 
 		 582 aa  97.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  45.67 
 
 		 423 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  45.67 
 
 		 423 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  47.62 
 
 		 788 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  41.54 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  46.22 
 
 		 390 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  47.79 
 
 		 199 aa  95.9  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  39.49 
 
 		 324 aa  95.9  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  34.23 
 
 		 564 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  46.72 
 
 		 442 aa  95.9  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  40.74 
 
 		 468 aa  95.5  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  45.37 
 
 		 354 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.67 
 
 		 376 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>