More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2938 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2938  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
350 aa  702    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2621  M24/M37 family peptidase  95.14 
 
 
350 aa  625  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  33.14 
 
 
582 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.89 
 
 
468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.77 
 
 
452 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  39.56 
 
 
482 aa  122  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  39.08 
 
 
448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  50 
 
 
824 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  39.77 
 
 
446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  47.5 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  48.31 
 
 
590 aa  114  3e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  49.15 
 
 
195 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  45.04 
 
 
399 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.06 
 
 
301 aa  112  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  45.04 
 
 
399 aa  112  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  33.58 
 
 
441 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  42.34 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  38.92 
 
 
323 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  47.86 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  49.15 
 
 
751 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  34.11 
 
 
377 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  44.95 
 
 
491 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  42.62 
 
 
305 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  39.1 
 
 
430 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  41.45 
 
 
375 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  43.65 
 
 
431 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  44.12 
 
 
754 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  47.86 
 
 
358 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1779  Peptidase M23  40.28 
 
 
354 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.53 
 
 
303 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  46.61 
 
 
727 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  47.37 
 
 
349 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  46.61 
 
 
727 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  50 
 
 
375 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  53.12 
 
 
266 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  47.15 
 
 
320 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.55 
 
 
321 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  43.45 
 
 
420 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  39.13 
 
 
376 aa  104  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  46.46 
 
 
425 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  43.61 
 
 
312 aa  104  3e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44.54 
 
 
274 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  32.23 
 
 
446 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  40.27 
 
 
305 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  46.61 
 
 
282 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  44.64 
 
 
283 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  41.27 
 
 
238 aa  103  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  42.76 
 
 
400 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  46.46 
 
 
425 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  44.07 
 
 
198 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  42.76 
 
 
421 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  42.76 
 
 
421 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  36.49 
 
 
450 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  38.12 
 
 
443 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  36.36 
 
 
295 aa  102  8e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  39.44 
 
 
468 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.08 
 
 
305 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  45.9 
 
 
305 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  46.36 
 
 
419 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.08 
 
 
305 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  45.67 
 
 
412 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  35.23 
 
 
348 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  30.19 
 
 
377 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  44.35 
 
 
385 aa  101  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  40.16 
 
 
414 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  43.22 
 
 
198 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  44.83 
 
 
442 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  47.83 
 
 
527 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  44.17 
 
 
367 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  43.36 
 
 
284 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0896  Peptidase M23  46.9 
 
 
352 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  44.12 
 
 
373 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  43.36 
 
 
292 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  41.73 
 
 
400 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  44.25 
 
 
294 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  44.17 
 
 
307 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  41.6 
 
 
442 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  28.92 
 
 
446 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  44.25 
 
 
291 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  43.33 
 
 
243 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  44.83 
 
 
379 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  46.9 
 
 
271 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  45.6 
 
 
388 aa  100  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  38.97 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  45.28 
 
 
447 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  45.28 
 
 
447 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  39.2 
 
 
423 aa  99.8  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  49.15 
 
 
360 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  33.54 
 
 
460 aa  99.8  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  43.22 
 
 
464 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  49.15 
 
 
360 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  49.15 
 
 
360 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  43.22 
 
 
301 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  53.26 
 
 
273 aa  99.4  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  40.48 
 
 
484 aa  99.4  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  46.15 
 
 
360 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  44.17 
 
 
352 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  37.11 
 
 
372 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  34.2 
 
 
351 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0953  Peptidase M23  44 
 
 
336 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>