More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1864 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  100 
 
 
351 aa  709    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  84.05 
 
 
348 aa  541  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  65.3 
 
 
360 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  64.84 
 
 
360 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  65.3 
 
 
360 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  48.5 
 
 
334 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  46.98 
 
 
340 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  46.98 
 
 
340 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  46.98 
 
 
340 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  47.9 
 
 
339 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  46.26 
 
 
339 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  48.69 
 
 
332 aa  235  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  44.8 
 
 
288 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  60.48 
 
 
727 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  60.48 
 
 
727 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  57.38 
 
 
751 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  60.32 
 
 
235 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  59.17 
 
 
754 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  46.34 
 
 
224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  60.83 
 
 
195 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  52.85 
 
 
590 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  56.45 
 
 
326 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  49.68 
 
 
198 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  49.04 
 
 
198 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  53.12 
 
 
406 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  52.03 
 
 
824 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  56.1 
 
 
511 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  42.27 
 
 
245 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  47.37 
 
 
272 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  51.91 
 
 
458 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  53.04 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  51.94 
 
 
251 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  55.83 
 
 
788 aa  133  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  47.29 
 
 
340 aa  133  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  55.65 
 
 
349 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  50.82 
 
 
358 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  53.33 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  53.08 
 
 
320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  43.58 
 
 
346 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  40.98 
 
 
452 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  53.6 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  49.18 
 
 
360 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  48.84 
 
 
199 aa  126  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  50 
 
 
274 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  50.74 
 
 
383 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  46.4 
 
 
236 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  35.17 
 
 
231 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  43.21 
 
 
491 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  51.22 
 
 
311 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  44.37 
 
 
376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  35.15 
 
 
269 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  52.85 
 
 
311 aa  116  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  51.72 
 
 
443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  50 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  52.85 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.84 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  44.44 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.81 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  55.17 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  55.17 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  54.31 
 
 
292 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  48.48 
 
 
284 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  48.09 
 
 
446 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  41.61 
 
 
300 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  45.8 
 
 
447 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  50.85 
 
 
402 aa  112  9e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  45.8 
 
 
447 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  42.86 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  48.8 
 
 
394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  47.41 
 
 
482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  50.81 
 
 
301 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  48.33 
 
 
582 aa  110  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.53 
 
 
304 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  52.59 
 
 
284 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  45.93 
 
 
318 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  46.22 
 
 
468 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  48.78 
 
 
375 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  48.25 
 
 
448 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  53.45 
 
 
442 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  41.77 
 
 
377 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  42.07 
 
 
241 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0824  Peptidase M23  49.65 
 
 
378 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  46.4 
 
 
398 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  49.18 
 
 
367 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  40.74 
 
 
247 aa  107  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  48.8 
 
 
243 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  49.56 
 
 
314 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  46.46 
 
 
424 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  46.46 
 
 
421 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3592  peptidase M23B  43.75 
 
 
321 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  44.53 
 
 
266 aa  107  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  47.86 
 
 
442 aa  106  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  45.53 
 
 
305 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  52.99 
 
 
283 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  43.92 
 
 
247 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  46.15 
 
 
424 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  47.2 
 
 
238 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  47.5 
 
 
419 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.86 
 
 
328 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  45.6 
 
 
313 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>