More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6511 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  54.5 
 
 
235 aa  212  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  51.87 
 
 
288 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  51.83 
 
 
339 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  50.6 
 
 
339 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  50 
 
 
340 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  50 
 
 
360 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  50 
 
 
360 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  50 
 
 
360 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.82 
 
 
326 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  48.21 
 
 
340 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  48.21 
 
 
340 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  51.57 
 
 
245 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  61.98 
 
 
348 aa  161  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  60.66 
 
 
199 aa  160  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  61.07 
 
 
251 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  46.34 
 
 
351 aa  152  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  45.73 
 
 
348 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  45.18 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  52.31 
 
 
332 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  44.07 
 
 
340 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  46.45 
 
 
272 aa  138  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  54.4 
 
 
406 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  55.38 
 
 
320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  51.94 
 
 
458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  48.41 
 
 
311 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  48.41 
 
 
311 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  40.41 
 
 
346 aa  122  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.76 
 
 
751 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  51.89 
 
 
727 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  51.89 
 
 
727 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  47.58 
 
 
590 aa  119  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  46.34 
 
 
452 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  47.69 
 
 
447 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  46.32 
 
 
349 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  47.69 
 
 
447 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  46.77 
 
 
824 aa  113  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  45.97 
 
 
311 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 
358 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  46.28 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  46.92 
 
 
446 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  48.76 
 
 
195 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.28 
 
 
198 aa  111  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  45.31 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  45 
 
 
333 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 
754 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  47.15 
 
 
511 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  43.86 
 
 
491 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  36.23 
 
 
284 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  44.44 
 
 
271 aa  105  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  35.03 
 
 
291 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  47.86 
 
 
294 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  37.5 
 
 
323 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  47.01 
 
 
292 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  44.72 
 
 
360 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  45.53 
 
 
367 aa  103  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  47.86 
 
 
291 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  41.3 
 
 
383 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  34.53 
 
 
321 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3571  M23 peptidase domain protein  43.51 
 
 
441 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  44.19 
 
 
270 aa  101  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  35.09 
 
 
442 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  40.94 
 
 
603 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  40.94 
 
 
603 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  43.2 
 
 
402 aa  100  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  40.54 
 
 
333 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5760  peptidase M23B  42.75 
 
 
443 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  41.98 
 
 
419 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  35.92 
 
 
564 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  35.92 
 
 
564 aa  98.6  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  36.17 
 
 
564 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  43.33 
 
 
445 aa  98.2  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  36.17 
 
 
564 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  36.87 
 
 
237 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  43.75 
 
 
466 aa  97.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  46.3 
 
 
414 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  43.48 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  33.68 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  46.3 
 
 
424 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  46.3 
 
 
421 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  37.65 
 
 
271 aa  96.3  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  44.35 
 
 
283 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  43.59 
 
 
482 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  35.46 
 
 
564 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  38.82 
 
 
298 aa  95.1  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  40 
 
 
282 aa  95.5  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  45.87 
 
 
424 aa  94.7  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.15 
 
 
274 aa  94.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  46.3 
 
 
423 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  46.3 
 
 
417 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  46.3 
 
 
423 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  46.3 
 
 
423 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  41.04 
 
 
468 aa  94  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  46.3 
 
 
417 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  41.73 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  46.3 
 
 
423 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  44.44 
 
 
284 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  46.3 
 
 
423 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  32.98 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  39.37 
 
 
417 aa  93.2  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>