More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04900 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  54.3 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  64 
 
 		 288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  54.71 
 
 		 339 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  56.21 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  54.12 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  52.94 
 
 		 340 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  52.94 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  52.94 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  60.28 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  66.67 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  57.14 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  50.59 
 
 		 348 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  47.06 
 
 		 360 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  47.06 
 
 		 360 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  47.06 
 
 		 360 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  50 
 
 		 351 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  60.98 
 
 		 199 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  52.78 
 
 		 340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  56.15 
 
 		 332 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  60.31 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  52.83 
 
 		 272 aa  158  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  57.58 
 
 		 320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  56.59 
 
 		 458 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  57.6 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  57.6 
 
 		 311 aa  138  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  53.6 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  40.85 
 
 		 346 aa  135  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  50.36 
 
 		 311 aa  131  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  51.61 
 
 		 727 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  51.61 
 
 		 727 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  41.21 
 
 		 271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  51.67 
 
 		 751 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  46.32 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 754 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  49.59 
 
 		 590 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  47.11 
 
 		 452 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  35.96 
 
 		 231 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  51.67 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  50.41 
 
 		 824 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  41.86 
 
 		 284 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  49.17 
 
 		 198 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  49.17 
 
 		 198 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  52.89 
 
 		 511 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  50 
 
 		 466 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  47.01 
 
 		 491 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  48.74 
 
 		 349 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  40.91 
 
 		 564 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  40.26 
 
 		 564 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  40.26 
 
 		 564 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  40.26 
 
 		 564 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  40.26 
 
 		 564 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  45.8 
 
 		 358 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  38.83 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  38.98 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  37.09 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  36.81 
 
 		 333 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.94 
 
 		 321 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  43.48 
 
 		 446 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  42.03 
 
 		 447 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  42.03 
 
 		 447 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  46.83 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.74 
 
 		 375 aa  104  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1152  peptidase M23B  49.54 
 
 		 414 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000291008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  34.24 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  40.52 
 
 		 445 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  41.91 
 
 		 383 aa  102  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  47.46 
 
 		 442 aa  102  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  43.55 
 
 		 360 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  51.61 
 
 		 788 aa  102  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  44 
 
 		 417 aa  102  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  44.63 
 
 		 367 aa  101  8e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  46.09 
 
 		 294 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  45.24 
 
 		 697 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  45.22 
 
 		 482 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  34.95 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  46.09 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  45.24 
 
 		 697 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  45.22 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  44.44 
 
 		 699 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  44.54 
 
 		 419 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  36.7 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  43.55 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  46.55 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  48.36 
 
 		 443 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  48.62 
 
 		 421 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  42.74 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  48.62 
 
 		 424 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.47 
 
 		 468 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  38.04 
 
 		 379 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  44.88 
 
 		 603 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  44.88 
 
 		 603 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  48.62 
 
 		 417 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  48.62 
 
 		 423 aa  97.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  48.62 
 
 		 423 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  45.38 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  48.62 
 
 		 417 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  35.71 
 
 		 305 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  48.62 
 
 		 423 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  48.62 
 
 		 423 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>