More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1843 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  90.32 
 
 
186 aa  337  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  60 
 
 
184 aa  214  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  55.29 
 
 
192 aa  181  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  45.71 
 
 
198 aa  150  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  54.41 
 
 
199 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  52.08 
 
 
251 aa  140  9e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  53.91 
 
 
301 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  56.14 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  55.17 
 
 
247 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  55 
 
 
252 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  48.36 
 
 
430 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  49.57 
 
 
314 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  49.61 
 
 
247 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  54.31 
 
 
194 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  47.66 
 
 
610 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  53.91 
 
 
285 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  50 
 
 
605 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  47.46 
 
 
375 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  48.82 
 
 
241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.13 
 
 
243 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  50.38 
 
 
238 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44.54 
 
 
274 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  49.11 
 
 
388 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.32 
 
 
304 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  47.37 
 
 
324 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  45.31 
 
 
419 aa  112  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  49.62 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  49.57 
 
 
321 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  47.32 
 
 
334 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  45.9 
 
 
363 aa  108  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  45.76 
 
 
417 aa  108  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  39.02 
 
 
249 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  44.17 
 
 
265 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  50.89 
 
 
299 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  44.44 
 
 
230 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  51.82 
 
 
442 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  44.74 
 
 
377 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  46.55 
 
 
316 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  45.04 
 
 
346 aa  104  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  45.76 
 
 
367 aa  104  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03251  peptidase, M23/M37 family protein  49.11 
 
 
292 aa  104  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  44.64 
 
 
271 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  42.37 
 
 
411 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  43.86 
 
 
308 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  46.09 
 
 
300 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  52.29 
 
 
240 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  46.72 
 
 
590 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  44.64 
 
 
271 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.22 
 
 
305 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  43.44 
 
 
824 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  48.78 
 
 
453 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  46.09 
 
 
298 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.22 
 
 
305 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  43.48 
 
 
305 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  49.57 
 
 
299 aa  101  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  47.15 
 
 
348 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  44.26 
 
 
582 aa  101  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  48.65 
 
 
299 aa  101  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  45.45 
 
 
321 aa  101  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  47.22 
 
 
303 aa  101  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  47.58 
 
 
454 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  46.3 
 
 
312 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  47.75 
 
 
299 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  46.55 
 
 
313 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  47.27 
 
 
387 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  47.5 
 
 
445 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  44.88 
 
 
328 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  47.58 
 
 
455 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  44.04 
 
 
223 aa  100  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  41.61 
 
 
491 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  40.3 
 
 
303 aa  99.8  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  45.22 
 
 
305 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  43.44 
 
 
216 aa  99.4  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  42.4 
 
 
358 aa  99.8  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  47.83 
 
 
318 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  46.79 
 
 
323 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  46.28 
 
 
351 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  48.65 
 
 
299 aa  100  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  40 
 
 
332 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  47.75 
 
 
323 aa  99  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  42.31 
 
 
460 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  41.03 
 
 
271 aa  99.4  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  45.08 
 
 
751 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  47.37 
 
 
313 aa  99.4  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  48.65 
 
 
299 aa  99.4  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  46.02 
 
 
468 aa  98.6  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39.82 
 
 
282 aa  99  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  47.75 
 
 
299 aa  98.6  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  41.53 
 
 
404 aa  98.6  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  46.22 
 
 
1019 aa  98.6  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  40.6 
 
 
248 aa  98.2  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  44.35 
 
 
310 aa  98.2  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  42.96 
 
 
238 aa  98.2  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  45 
 
 
372 aa  97.8  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  45.13 
 
 
300 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  44.8 
 
 
284 aa  97.8  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  43.86 
 
 
431 aa  97.8  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  44.64 
 
 
315 aa  97.4  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1006  Peptidase M23  43.22 
 
 
324 aa  97.8  9e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>