More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1574 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1574  putative phage structural protein  100 
 
 
1019 aa  2081    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0599  phage endopeptidase  34.48 
 
 
807 aa  179  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  41.1 
 
 
399 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  41.1 
 
 
399 aa  112  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  45.31 
 
 
376 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  47.27 
 
 
301 aa  105  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  45.45 
 
 
269 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1707  phage minor structural protein  27.94 
 
 
634 aa  102  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  47.06 
 
 
402 aa  101  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  42.15 
 
 
243 aa  101  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  44.07 
 
 
332 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.74 
 
 
321 aa  100  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  42.62 
 
 
340 aa  100  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  44.44 
 
 
379 aa  99.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  49 
 
 
288 aa  99.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  43.7 
 
 
186 aa  99  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  46.22 
 
 
186 aa  99  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  40.5 
 
 
238 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  43.97 
 
 
284 aa  98.6  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  50.54 
 
 
411 aa  98.6  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  48.98 
 
 
294 aa  98.2  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  48.98 
 
 
292 aa  98.2  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  48.98 
 
 
291 aa  98.2  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  45 
 
 
238 aa  97.8  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  41.41 
 
 
290 aa  97.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  40.5 
 
 
238 aa  97.1  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  39.34 
 
 
270 aa  96.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  35.43 
 
 
375 aa  96.3  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  44.44 
 
 
282 aa  95.9  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  40.98 
 
 
455 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  44.25 
 
 
251 aa  95.5  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  40 
 
 
332 aa  95.5  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3119  peptidase M23B  39.01 
 
 
310 aa  95.9  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0986889  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  40.62 
 
 
318 aa  95.5  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  45.74 
 
 
414 aa  95.5  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0795  peptidase M23B  41.41 
 
 
316 aa  95.5  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.244316 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  42.11 
 
 
404 aa  95.5  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  47.57 
 
 
419 aa  95.1  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  42.06 
 
 
442 aa  94.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2835  putative transmembrane protein  44.07 
 
 
321 aa  94.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.499363  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  42.62 
 
 
291 aa  94.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  43.22 
 
 
216 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  42.24 
 
 
305 aa  94.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.42 
 
 
372 aa  94.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0827  peptidase M23B  40.48 
 
 
327 aa  94  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  40 
 
 
283 aa  93.2  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2715  Peptidase M23  43.22 
 
 
320 aa  93.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.795153  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  48.39 
 
 
727 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1077  Peptidase M23  40.85 
 
 
507 aa  93.2  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.391765  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  48.39 
 
 
727 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  37.4 
 
 
373 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  39.69 
 
 
323 aa  93.2  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3080  Peptidase M23  43.22 
 
 
321 aa  93.6  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.387864  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.24 
 
 
305 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.24 
 
 
305 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.22 
 
 
468 aa  93.2  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  48.94 
 
 
400 aa  92.8  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  43.12 
 
 
297 aa  92.8  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  43.7 
 
 
447 aa  92.4  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  39.5 
 
 
320 aa  92.8  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  36.14 
 
 
377 aa  92.8  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  43.1 
 
 
192 aa  92.4  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0025  peptidase M23B  44.12 
 
 
402 aa  92.4  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.025775 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.75 
 
 
309 aa  92  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3929  peptidase M23B  40.5 
 
 
319 aa  92.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  41.82 
 
 
454 aa  92  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  41.91 
 
 
469 aa  92  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  44.14 
 
 
184 aa  91.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  48.45 
 
 
348 aa  91.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  37.69 
 
 
249 aa  91.3  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.37 
 
 
431 aa  91.3  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  39.13 
 
 
198 aa  91.3  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.62 
 
 
274 aa  90.9  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  45.05 
 
 
241 aa  90.5  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  46.15 
 
 
247 aa  90.9  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  38.35 
 
 
367 aa  90.9  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  41.53 
 
 
430 aa  90.9  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  41.82 
 
 
455 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  42.37 
 
 
441 aa  90.5  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  40.68 
 
 
314 aa  90.5  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  36.59 
 
 
379 aa  90.5  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2192  M24/M37 family peptidase  41.18 
 
 
337 aa  89.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  37.82 
 
 
313 aa  90.1  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  42.86 
 
 
374 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  35.11 
 
 
229 aa  90.1  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  40.68 
 
 
402 aa  89.7  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  45.19 
 
 
460 aa  89.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0367  tagE protein  37.78 
 
 
302 aa  89.7  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  40.16 
 
 
423 aa  90.1  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39790  Peptidase  41.9 
 
 
274 aa  89.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.315957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3690  peptidase M23B  44.12 
 
 
328 aa  89.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  40.2 
 
 
230 aa  89.7  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  42.55 
 
 
274 aa  89.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1258  peptidase M23B  40 
 
 
274 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  40.31 
 
 
288 aa  89.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  38.41 
 
 
198 aa  89.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  39.5 
 
 
456 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  45.05 
 
 
430 aa  89.7  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  41.38 
 
 
305 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  50 
 
 
550 aa  89.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>