More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1350 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  55.87 
 
 		 252 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  45.02 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  43.14 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  44.35 
 
 		 285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  40 
 
 		 241 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  40.51 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  50.39 
 
 		 251 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  52.21 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  49.23 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  45.04 
 
 		 610 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  51.79 
 
 		 309 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  54.21 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  43.92 
 
 		 388 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  54.21 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  54.21 
 
 		 238 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  43.18 
 
 		 369 aa  105  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  44.26 
 
 		 605 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  43.18 
 
 		 319 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  50.46 
 
 		 411 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  46.03 
 
 		 318 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  49.07 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  52.29 
 
 		 186 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  48.6 
 
 		 314 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2119  Peptidase M23  49.61 
 
 		 440 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12383  hitchhiker  0.00773867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  52.29 
 
 		 186 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1912  Peptidase M23  52.94 
 
 		 439 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620351 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  49.07 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  49.57 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3764  peptidase M23B  50.41 
 
 		 194 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000390707  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  46.03 
 
 		 419 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  47.66 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  33.73 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  49.12 
 
 		 184 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  49.06 
 
 		 332 aa  99.4  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  47.24 
 
 		 284 aa  99  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  50 
 
 		 299 aa  98.6  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  53.7 
 
 		 379 aa  98.6  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  49.11 
 
 		 299 aa  98.6  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  46.73 
 
 		 310 aa  98.6  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  46.21 
 
 		 400 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  44.44 
 
 		 282 aa  97.8  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  49.15 
 
 		 394 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.48 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  42.75 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  50 
 
 		 299 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  50.91 
 
 		 375 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  50 
 
 		 375 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1477  peptidase M23B  52.94 
 
 		 442 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.707432  normal  0.0152979 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  46.21 
 
 		 404 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  47.32 
 
 		 374 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  48.08 
 
 		 318 aa  96.3  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  48.15 
 
 		 430 aa  95.9  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  49.09 
 
 		 314 aa  95.9  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  50 
 
 		 294 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  39.6 
 
 		 468 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  48.18 
 
 		 375 aa  95.5  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4455  M23/M37 peptidase domain-containing protein  45.13 
 
 		 298 aa  95.1  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  45.9 
 
 		 430 aa  95.1  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  40.15 
 
 		 223 aa  95.1  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  49.09 
 
 		 292 aa  95.1  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  42.03 
 
 		 384 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  48.65 
 
 		 374 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3804  peptidase M23B  48.21 
 
 		 299 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000819764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  47.86 
 
 		 299 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  48.18 
 
 		 284 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  34.5 
 
 		 308 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  50 
 
 		 423 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  47.22 
 
 		 541 aa  94  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  47.86 
 
 		 299 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.07 
 
 		 304 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  48.25 
 
 		 324 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  47.86 
 
 		 299 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  49.11 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  47.86 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  47.32 
 
 		 299 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  48.74 
 
 		 192 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  48.54 
 
 		 446 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1304  peptidase M23B  45.71 
 
 		 413 aa  92.8  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137059  normal  0.602682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  40.3 
 
 		 274 aa  92.8  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  49.54 
 
 		 376 aa  92.8  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5898  Peptidase M23  48.67 
 
 		 332 aa  92.8  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.941404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  49.09 
 
 		 291 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  45.87 
 
 		 230 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  44.8 
 
 		 296 aa  92.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  48.08 
 
 		 367 aa  92.4  6e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3617  peptidase M23B  47.27 
 
 		 457 aa  92  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0923859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3955  peptidase M23B  47.27 
 
 		 457 aa  92  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.053083  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  47.57 
 
 		 460 aa  91.7  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  46.55 
 
 		 299 aa  92  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  48.15 
 
 		 377 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.74 
 
 		 305 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  43.8 
 
 		 372 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  48.04 
 
 		 450 aa  91.7  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  45.54 
 
 		 392 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  48.18 
 
 		 464 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  46.15 
 
 		 299 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  40.8 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.74 
 
 		 305 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  47.32 
 
 		 299 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>